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Global Omic Data Integration on Animal, Vegetal and Environment Sectors

Descripción del proyecto

Una plataforma innovadora para comprender mejor los vínculos entre el genotipo y el fenotipo

La investigación en ciencias ómicas se ha visto transformada por el análisis de datos masivos y la inteligencia artificial (IA). El objetivo del proyecto GLOMICAVE, financiado por con fondos europeos, es construir sistemas que permitan la integración de datos procedentes de experimentos ómicos a gran escala. El trabajo del proyecto dará lugar a una plataforma en la nube para el análisis de datos multiómicos, que se basa en el análisis de datos masivos y la IA y utiliza conjuntos de datos ómicos experimentales y de acceso público a gran escala. La plataforma ayudará a personas expertas y legas a determinar y comprender los vínculos entre genotipos y fenotipos (no humanos) aplicables en diferentes ámbitos. El método del proyecto se validará en los sectores de la ganadería, la agrobiotecnología y el medio ambiente.

Objetivo

Massive increases in analytical throughput together with reductions in costs have enabled multi-omics studies to be routinely performed at a scale not previously imagined. Two main barriers hamper our ability to reveal the mechanism behind a specific genotype-phenotype link: the cross-talk between multiple molecular layers cannot be properly assessed by a reductionist approach that analyses each omics layer in isolation; and the ever-growing amount of buried information in scientific literature and public omics datasets cannot be extracted without intelligent computational approaches.

GLOMICAVE project addresses the need for building systems that allow streamlining both the experimental design and the analysis and integration at a systems level of large-scale omics experiments by maximizing the utility of pre-existing massive omics datasets and scientific literature to increase the understanding of biological systems as a whole.

The main outcome will be a multi-omics data analysis cloud-based platform, relying on Big Data Analytics and Artificial Intelligence techniques – and using large-scale publicly available and experimental omics datasets, enhanced with an automatic processing of scientific literature, to assist experts and non-experts in identifying and understanding new links between genotype and phenotype which apply to different domains.

GLOMICAVE integrative approach will be validated in 3 different industrial sectors (livestock, agro-biotechnology and environment) addressing specific challenges in 6 business cases, which will pave the way for further uptake in other business areas.

The success of GLOMICAVE builds upon the expertise of a multidisciplinary team of 14 partners with expertise in omics sciences; standardization; bioinformatics; environmental assessment; mathematical modelling; AI and BDA; plant and animal physiology; food quality, microbiology; bioengineering as well as ethical, legal and social aspects.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.

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Convocatoria de propuestas

H2020-NMBP-TR-IND-2018-2020

Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Convocatoria de subcontratación

H2020-NMBP-TR-IND-2020-twostage

Régimen de financiación

RIA - Research and Innovation action

Coordinador

FUNDACIO EURECAT
Aportación neta de la UEn
€ 1 095 875,00
Dirección
AVENIDA UNIVERSITAT AUTONOMA 23
08290 Cerdanyola Del Valles (Barcelona)
España

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Región
Este Cataluña Barcelona
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total
€ 1 095 875,00

Participantes (15)