Description du projet
Une plateforme innovante qui améliore notre compréhension des liens entre les génotypes et les phénotypes
L’analyse des mégadonnées (BDA pour Big Data analytics) et l’intelligence artificielle (IA) ont révolutionné la recherche dans le domaine des sciences omiques. Le projet GLOMICAVE, financé par l’UE, vise à mettre en place des systèmes permettant l’intégration de données provenant d’expériences omiques à grande échelle. Les travaux du projet permettront de créer une plateforme cloud d’analyse de données multi-omiques qui repose sur la BDA et l’IA et exploite des ensembles de données omiques expérimentales et accessibles au public à grande échelle. La plateforme aidera les experts et les profanes à identifier et à comprendre les nouveaux liens entre les génotypes et les phénotypes (non humains), tels qu’ils s’appliquent à différents domaines. L’approche du projet sera validée dans les secteurs du bétail, de l’agro-biotechnologie et de l’environnement.
Objectif
Massive increases in analytical throughput together with reductions in costs have enabled multi-omics studies to be routinely performed at a scale not previously imagined. Two main barriers hamper our ability to reveal the mechanism behind a specific genotype-phenotype link: the cross-talk between multiple molecular layers cannot be properly assessed by a reductionist approach that analyses each omics layer in isolation; and the ever-growing amount of buried information in scientific literature and public omics datasets cannot be extracted without intelligent computational approaches.
GLOMICAVE project addresses the need for building systems that allow streamlining both the experimental design and the analysis and integration at a systems level of large-scale omics experiments by maximizing the utility of pre-existing massive omics datasets and scientific literature to increase the understanding of biological systems as a whole.
The main outcome will be a multi-omics data analysis cloud-based platform, relying on Big Data Analytics and Artificial Intelligence techniques – and using large-scale publicly available and experimental omics datasets, enhanced with an automatic processing of scientific literature, to assist experts and non-experts in identifying and understanding new links between genotype and phenotype which apply to different domains.
GLOMICAVE integrative approach will be validated in 3 different industrial sectors (livestock, agro-biotechnology and environment) addressing specific challenges in 6 business cases, which will pave the way for further uptake in other business areas.
The success of GLOMICAVE builds upon the expertise of a multidisciplinary team of 14 partners with expertise in omics sciences; standardization; bioinformatics; environmental assessment; mathematical modelling; AI and BDA; plant and animal physiology; food quality, microbiology; bioengineering as well as ethical, legal and social aspects.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
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Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
RIA - Research and Innovation actionCoordinateur
08290 Cerdanyola Del Valles (Barcelona)
Espagne