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Contenuto archiviato il 2024-04-30

Establishment of pcr-based site-selected mutagenesis in 'arabidopsis' to inactive genes putatively involved in disease resistance

Obiettivo



Research objectives and content
The DNA sequence of the Arabidopsis genome is being determined. The function of genes identified by sequencing will be a major focus of biological research. I will (with others) develop a 'mutation machine' in Arabidopsis which will facilitate the isolation of insertion mutations in any known DNA sequence. Analysis of mutant phenotypes will give information on gene function. The approach involves saturation insertion mutagenesis; identification of mutations in specific genes can then be achieved with a PCR screen. We will use the En(Spm)/l(dSpm) transposon system which is active in Arabidopsis. By selecting directly for transposed dSpm elements, we aim to produce at least 57,600 transposants. With this level of saturation, it should be possible to identify an insertion in any Arabidospsis gene (average size of 3.2 kb) with a probability of 82%. The mutation machine is being developed in the Jones lab to test whether certain genes whose induction or activation has been correlated with defense response really play an indispensable role in resistance. In particular, to test the mutation machine, I will target the following genes: (1) NADPH oxidase genes homologues from mammalian NADPH oxidases (2) calcium-dependent protein kinases (3) glucanases and chitinases. Training content (objective, benefit and expected impact)
Working on this project is very interesting to me for several reasons: -It will allow me to learn about plant pathology in an environment that is perfectly suited for this purpose -It will give me experience with the model plant Arabidopsis which I plan to continue using after this position -Finally, in addition of mutations that will be analyzed in this work, the mutation machine will provide material that will be useful for future studies. All three aspects will useful to me later as I plan to continue investigating the mechanisms involved in disease resistance. Links with industry / industrial relevance (22)

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

Dati non disponibili

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

RGI - Research grants (individual fellowships)

Coordinatore

THE SAINSBURY LABORATORY
Contributo UE
Nessun dato
Indirizzo
Norwich Research Park, Colney Lane
NR47UH NORWICH
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (1)

Il mio fascicolo 0 0