Objectif
One of the goals of mapping the human genome is to determine the genetic basis for disease. Chromosomal areas harbouring disease-related genes can be identified by genetic marker analysis, i.e. scanning the genome at many sites for genetic variation associated with the disease. In the ongoing EC project GENO-CT9I-0021 the two-dimensional (2-D) DNA typing technique is evaluated for its potential to measure DNA sequence variation at many sites in the genome simultaneously. The method is based on hybridization analysis of a 2-D separation pattern of a genomic DNA restriction enzyme digest using micro- and minisatellite core probes which detect many highly informative VNTRs. Major applications of 2-D DNA typing include analysing somatic genetic instabilities, e.g. occurring in tumorigenesis, and linkage analysis of genetic diseases. In the first phase of the proposed project 2-D DNA typing will be used (1) to further analyse CEPH pedigrees to develop more genetic markers, and (2) to develop a 2-D spot variant database which will be linked to databases containing physical mapping information. To facilitate the 2-D DNA typing procedure a newly developed apparatus will be used in which the first and second electrophoretic separation can be run in a single gel without manual interference. Subsequently, the 2-D method will be applied to compare tumor DNA with normal DNA from patients with cancer. 2-D DNA typing allows detection of allelic imbalance due to deletion and/or amplification at many chromosomal sites. This approach will identify genetic:markers and corresponding YAC clones to map chromosomal regions most likely containing tumor associated genes. In addition, 2-D DNA typing will be used to analyse genomic DNA of patients with diseases with genetic anticipation (myotonic Dystrophy and fragile X), using core probes for (CNG). motifs. Expansion of (CNG) repeats 5' and 3' of these disease genes has been shown to correllate with severity of the disease. Screening genomic DNA of patients with similar diseases by 2-D DNA typing with microsatellite core probes might identify genomic regions associated with these diseases. Finally, 2-D DNA typing will be used for pedigree analysis to detect genetic linkage with a disease gene. The expected results of the project include VNTR genetic markers, DNA markers for genetic diseases including cancer, and an optimized 2-D DNA typing protocol for analysing human genomic DNA.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles informatique et science de l'information bases de données
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Données non disponibles
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
2300 AR Leiden
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.