Obiettivo
High resolution analysis of gene expression can be performed by RNA in situ hybridization, which allows definition of gene expression with great accuracy, this revealing temporal gene activity in individual cells or groups of cells. To apply the power of this high-resolution procedure to the vast resource of cDNAs contained in the evergrowing public sequence databases, seven European groups decided to undertake a concert effort in: a) developing a plan for international coordination on gene expression studies; and b) carrying out a high-throughput expression study of a large number of genes of high biological interest in developing mouse and human embryos as well as in adult mouse brain.
The main objectives of this proposal are:
1) Select and retrieve a collection of genes of biological value based on extensive bioinformatic analysis of public sequence database. This selection will be based on an extensive bioinformatic analysis of public sequence databases, such as dbEST and UniGene.
2) Perform a high-throughput expression study of the genes identified in objective 1, in developing mouse and human embryos and in adult mouse brain. The high-throughput in situ hybridization studies will be conducted by using an automated in situ hybridization (ISH) procedure, under development by the applicants. Using these procedures, 2,000-6,000 murine and 200-400 human cDNAs will be analyzed in the course of this project.
3) Construct two project-specific database (Mapped Image Database and Archive Image Database) for the submission, storage, management and release to the scientific community of the expression data generated in this project.
The high-throughput RNA in situ hybridization analysis described in this proposal will:
- be of crucial importance to better understand the physiological role of a given gene/protein in a living organism;
- provide new insights into mammalian gene functions and investigate their possible role in inherited diseases;
- be instrumental for predicting the phenotypic consequences of gene disruption in mouse mutants;
- provide insight into gene product interactions or indicate hierarchies of gene expression networks.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione basi di dati
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA trascrittomi
- scienze mediche e della salute medicina clinica embriologia
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
80131 NAPOLI
Italia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.