Pour la découverte de médicaments plus rapide
Les innovations récentes dans le domaine de l'automatisation et le traitement de données ont permis aux scientifiques de mener rapidement des millions de tests chimiques, génétiques et pharmacologiques. Plus particulièrement, la technique du criblage à haut débit a révolutionné le domaine de la découverte de médicaments. Durant ce processus, des millions de protéines ou de gènes sont passés en revue pour détecter des propriétés thérapeutiques qui peuvent être utilisées dans les médicaments. Étant donné que certains médicaments s'attachent à une protéine cible spécifique pour s'activer, les chercheurs se sont intéressés à découvrir leurs sites de liaison. Financé par l'UE, le projet TARGETBINDER(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) (Target binders) cherchait à découvrir les peptides qui s'attachent à des protéines cibles pharmaceutiquement intéressantes. Les chercheurs ont ensuite testé ces peptides en fonction de leur affinité de liaison en vue de développer de nouveaux médicaments. TARGETBINDER a développé une méthode pour dépister de nombreux différents peptides par protéine cible. D'abord, ils ont utilisé une technique de variante d'affichage ribosomique pour détecter plus de 10 (ou 11) différents peptides pour la liaison. Le séquençage de nouvelle génération a ensuite proposé une liste de plus de 10 000 liants peptidiques candidats synthétisés sur une lame de verre. Ils ont ensuite validé ces liants en marquant différentes protéines candidates. Parallèlement, ils ont développé un appareil automatique capable de mesurer la force de liaison pour 10 000 peptides par centimètre carré sur chaque lame de verre. Une fois qu'ils ont découvert des liants peptidiques à affinité forte, ils les ont testés dans des tests quantitatifs. Les chercheurs ont ensuite synthétisé les liants peptidiques les plus intéressants sur des lames de verre spécialement développées à une densité de 10 000 peptides par centimètre carré. Après avoir confirmé leur forte affinité de liaison, les chercheurs ont finalement déterminé les signatures de liaisons ou les séquences d'acides aminés qui s'attachent à chaque peptide à sa protéine cible. Même si les chercheurs ont rencontré quelques difficultés à pousser les protéines cibles à se lier aux nouveaux peptides, certaines protéines pharmaceutiquement pertinentes y sont parvenues. L'une d'entre elle, la Grb2, est impliquée dans la croissance tumorale et est donc une cible potentielle pour les agents anticancéreux. En développant et en améliorant les techniques à haut débit, TARGETBINDER a mieux défini les méthodes pour la conception de médicaments. Elles auront un impact considérable sur la médecine et l'industrie biotechnologique.
