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Identification of novel genes conditioning bacterial blight resistance in rice using genomic resources and functional analysis tools

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La resistenza del riso alle malattie batteriche

Il riso costituisce una delle più importanti colture del mondo. Ottenere la resistenza delle colture alle malattie batteriche migliorerà la produzione e la sicurezza alimentare mondiale.

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Xanthomonas oryzae è un gruppo di batteri patogeni delle piante che causano la ruggine batterica e la malattia delle foglie nel riso. Queste malattie si presentano in diverse fasi della coltivazione e colpiscono gravemente la produzione di riso in tutto il mondo, in particolare nelle risaie irrigate. Capire in che modo il riso interagisce con i patogeni batterici per arrivare a sviluppare la resistenza o la malattia potrebbe portare alla creazione di approcci per la modificazione genetica della coltura. L’obiettivo del progetto RXOMICS (Identification of novel genes conditioning bacterial blight resistance in rice using genomic resources and functional analysis tools), finanziato dall’UE, era scoprire i geni responsabili della resistenza alle malattie del riso. A questo fine, i ricercatori hanno integrato approcci molecolari, genomici e genetici sia nel riso che nella X. oryzae. Il consorzio ha ottenuto una nuova risorsa di mappatura che ha permesso la rilevazione ad alta risoluzione di loci di carattere quantitativo in colture naturalmente resistenti. Hanno osservato che la X. oryzae conteneva effettori TAL (transcription activator-like) che attivavano i geni ospite legati a una maggiore vulnerabilità. Usando il ceppo X11-5A che ha una virulenza debole, i ricercatori hanno dimostrato che la somministrazione di effettori TAL provocava un aumento sostanziale della virulenza su diverse varietà di riso. Questo sistema ha permesso di studiare le interazioni di geni TAL-ospite e di identificare nuovi loci coinvolti nella resistenza all’infezione batterica. RXOMICS ha identificato anche un nuovo meccanismo di resistenza del riso che coinvolge gli effettori TAL. Un singolo locus dominante, chiamato Xo1(t), che mappa sul cromosoma 4 del genoma del riso era responsabile di questa resistenza contro il ceppo africano di X. oryzae. Un impegno considerevole è stato dedicato alla progettazione di strumenti diagnostici per i patogeni del riso. I risultati del progetto RXOMICS potrebbero migliorare la sicurezza alimentare mediante lo sviluppo sostenibile di coltivazioni di riso resistenti ai batteri.

Parole chiave

Resistenza del riso, Xanthomonas oryzae, ruggine batterica, effettore TAL

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