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Implementing DNA barcoding into aquatic biodiversity research in Portugal and priming new macrobenthos monitoring tools

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Des codes-barres pour les espèces d'eau du Portugal

Des chercheurs ont établi des librairies de référence d'ADN pour divers organismes marins et d'eau douce au Portugal.

Changement climatique et Environnement icon Changement climatique et Environnement

Le code à barres est utilisé pour identifier les espèces vivantes, et peut donc être utilisé comme outil de surveillance environnementale ou pour étendre les inventaires en termes de biodiversité. Le projet LUSOAQUABARCODE, financé par l'UE, a mis en œuvre le code à barres de l'ADN pour les communautés macrobenthiques marines et d'eau douce (certaines petites espèces marines, dont les éponges et les crustacés) au Portugal. Le projet s'est intéressé à l'expertise de nombreuses universités locales, instituts de recherche, le musée national d'histoire naturelle de Lisbonne et autres partenaires internationaux pour créer les bibliothèques. Plus de 300 invertébrés marins et plus de 150 espèces de poissons, dont les espèces les plus exploitées, ont été enregistrés. D'autres données telles que les coordonnées et les images de spécimens forment une partie des entrées de bibliothèque, disponibles en ligne sur Barcode of Life Data Systems. Dans le cadre du processus de catalogage, les chercheurs ont amélioré certains aspects techniques du codage à barres de l'ADN. Ils ont également introduit un système d'hiérarchie qui fournit un moyen empirique de juger la fiabilité de l'identification des espèces lors de l'utilisation de codes à barres de l'ADN. Les nouvelles bibliothèques permettront d'identifier les poissons et crustacés dans les marchés et les exploitations piscicoles. Elles permettront également une surveillance environnementale dans les communautés macrobentiques d'estuaires, en accord avec la directive cadre sur l'eau de l'UE.

Mots‑clés

Espèce d'eau, codage à barres de l'ADN, inventaires de la biodiversité, communautés macrobenthiques, surveillance environnementale

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