Renforcer la capacité de l'Europe dans les biotechnologies
Les recherches sur la diversité biologique menées par le CIBIO (Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos) au Portugal s'appuient en grande partie sur des études du génome. Pour les scientifiques, il est primordial d'utiliser les techniques les plus récentes afin de suivre les dernières tendances. Le projet CIBIO-NEW-GEN (Capacity building at CIBIO for research using next-gen sequencing), financé par l'UE, a mis au point une plateforme de séquençage de nouvelle génération et l'a intégrée au processus de recherche du CIBIO. Il a mis à niveau l'infrastructure du centre, et établi de nouveaux programmes de formation pour gérer la capacité renforcée. Le projet a acquis et mis en place deux systèmes de séquençage de nouvelle génération, à haut débit et à moyen débit, comme base pour la nouvelle plateforme. Il forme les opérateurs et a recruté des scientifiques expérimentés pour aider les chercheurs à exploiter tout le potentiel technique. Les séquenceurs Illumina choisis, les modèles HiSeq 1500 et MiSeq (de paillasse), comprennent divers équipements de soutien pour atteindre des processus complets de séquençage de nouvelle génération. Les protocoles ont été implémentés et le système a été testé en interne. Le CIBIO peut ainsi fournir plusieurs services de séquençage et d'analyse subséquente des données, en interne comme au niveau du Portugal. Une série de documentaires TV a été réalisée pendant le projet. Elle passe actuellement sur RTP1, la principale chaîne du pays, pour informer et intéresser le public. Les travaux du projet sont aussi diffusés par deux livrets couvrant les activités de recherche des instituts sur l'évolution et la préservation, ainsi que par des séminaires, des conférences, des réunions et des journées d'information. Ces activités ont permis au CIBIO de se mettre en relation avec le secteur public et le secteur privé. Le projet a terminé des propositions de collaboration, qui sont en cours de discussion avec des hôpitaux et des centres de recherche. Une société dérivée est prévue, en collaboration avec une société française des biotechnologies. Une recherche de qualité et une reconnaissance internationale permettront d'attirer davantage d'investissements privés et de garantir la pérennité du projet. Le CIBIO est devenu un acteur important de l'Espace européen de la recherche (EER), et a contribué activement à l'économie régionale et au bien-être social. Les activités de CIBIO-InBIO en matière de séquençage de nouvelle génération sont soutenues par un projet Horizon 2020 approuvé et lancé l'an dernier (EnvMetaGen – Capacity Building at InBIO for Research and Innovation Using Environmental Metagenomics, no 668981).
Mots‑clés
Biotechnologies, séquençage, biodiversité, CIBIO, séquençage de nouvelle génération, Espace européen de la recherche
