Budowanie potencjału biotechnologicznego w Europie
Centrum Badań nad Bioróżnorodnością i Zasobami Genetycznymi (CIBIO) Uniwersytetu w Porto w Portugalii większość swoich badań z zakresu różnorodności biologicznej opiera na badaniach genomowych. Aby nadążyć za aktualnymi trendami, dla naukowców decydujące znaczenie ma czerpanie korzyści z postępów technologicznych. Finansowany przez UE projekt CIBIO-NEW-GEN (Capacity building at CIBIO for research using next-gen sequencing) zaowocował stworzeniem platformy sekwencjonowania nowej generacji i zintegrowaniem jej z procedurami badawczymi w CIBIO. Poza uaktualnieniem istniejącej infrastruktury badawczej stworzono nowe programy szkoleniowe w celu dostosowania do większej liczby badań. W ramach projektu pozyskano i wdrożono dwa systemy sekwencjonowania nowej generacji (NGS) — jeden o wysokiej, drugi o średniej przepustowości. Stanowią one podstawę dla nowej platformy. Zorganizowano także szkolenia dla operatorów oraz przeprowadzono proces rekrutacji doświadczonych badaczy, którzy pomogą personelowi w pełni wykorzystać nową technologię. Wybrane sekwencery Illumina HiSeq 1500 oraz podręczny Illumina MiSeq zawierają różne urządzenia pomocnicze, dzięki którym przepływ pracy w ramach systemu NGS jest pełny i skuteczny. We własnym zakresie przeprowadzono testy oraz wdrożenia protokołów. Projekt CIBIO umożliwia obecnie przeprowadzenie zarówno wewnętrznie w ramach instytutu, jak i w całej Portugalii, kilku specyficznych analiz danych zgromadzonych w systemie NGS oraz wyprowadzanych z niego. Podczas realizacji projektu wyprodukowano serię telewizyjnych filmów dokumentalnych, które są obecnie emitowane w najpopularniejszej portugalskiej stacji telewizyjnej, RTP1, dzięki czemu widzowie wykazują większe zainteresowanie tematem i mają w nim większą wiedzę. Wyniki projektu zostały również zaprezentowane w dwóch broszurach o działaniach związanych z badaniami nad ewolucją oraz obsługą systemów NGS, na seminariach, konferencjach, spotkaniach oraz podczas dni otwartych. Rozpowszechnianie tych informacji umożliwiło CIBIO połączenie zarówno z sektorem prywatnym, jak i publicznym. Propozycje współpracy ze szpitalami i centrami badawczymi są w fazie realizacji lub omawiania. Planowane jest utworzenie spółki wydzielonej poprzez współpracę z francuską firmą biotechnologiczną. Badania o wysokiej jakości oraz uznanie międzynarodowe umożliwią przyciągnięcie większej liczby inwestycji prywatnych i sprawią, że poziom zrównoważenia projektu w dalszej perspektywie wzrośnie. Projekt CIBIO odgrywa znaczącą rolę w Europejskiej Przestrzeni Badawczej (EPB) i wnosi czynny wkład w gospodarkę regionalną i dobrostan społeczny. Działania CIBIO-InBIO w obszarze NGS są stale prowadzone w ramach projektu Horyzont 2020, który został zatwierdzony i zainicjowany w zeszłym roku (EnvMetaGen — Capacity Building at InBIO for Research and Innovation Using Environmental Metagenomics — nr referencyjny 668981).
