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Regulation of coupling between transcription and splicing during cell cycle progression and UV irradiation

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Splicing alternativo e RNA Polimerasi II

Nell’uomo l’errata regolazione dello splicing alternativo (AS) è collegato alla malattia ereditaria e probabilmente al cancro. Un progetto dell’UE è incentrato sulla comprensione del collegamento tra regolazione dell’AS e RNA polimerasi II (Pol II).

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L’AS è un importante processo regolato nell’espressione genica. Producendo dallo stesso gene proteine con composizione e funzioni differenti, l’AS crea un’enorme diversità proteomica negli uomini. Influenza anche vari processi come gli stadi dello sviluppo e le condizioni di malattia. Il progetto AS-ARK-JV-GD (Regulation of coupling between transcription and splicing during cell cycle progression and UV irradiation) ha studiato l’interazione tra AS e Pol II. Il progetto ha prima studiato in che modo l’iperfosforilazione di Pol II induce una diminuzione del tasso di elongazione di Pol II. Gli scienziati hanno confrontato i profili di Pol II in diversi comparti cellulari in presenza o assenza di irradiazione UV e del farmaco anticancro camptotecina. Hanno identificato una specifica proteina partner di Pol II che viene rilasciata in caso di danno del DNA. Questo fattore proteina può essere associato alla riduzione generale del tasso di elongazione della polimerasi. I risultati ottenuti hanno migliorato la nostra comprensione del modo in cui il tasso di Pol II e la regolazione dell’AS sono influenzati dal danno del DNA. Studiando la regolazione dello splicing co-trascrizionale gli scienziati hanno scoperto che un rallentamento nell’elongazione della trascrizione può favorire l’exon skipping (salto dell’esone), elemento importante per il trattamento del cancro. Questa importante scoperta è stata pubblicata. Un altro obiettivo era comprendere come le modifiche dell’AS influiscano sulla struttura della cromatina. Si è scoperto che il fattore di splicing generale U2AF65 è in grado di interagire con diversi segni istonici, o istoni modificati in modo covalente, principali componenti proteiche della cromatina. Ciò ha fornito informazioni sui meccanismi di regolazione dello splicing da parte della struttura della cromatina. L’AS influenza l’espressione di oltre metà dei geni umani, ed è un processo importante della biologia umana. Il progetto ha fatto fare importanti passi avanti alla nostra comprensione di questo processo complesso.

Parole chiave

Splicing alternativo, RNA polimerasi II, iperfosforilazione, danno del DNA, cromatina

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