Estimación de la variación genética en animales de granja
Los biólogos que estudian la variación genética son capaces de discriminar entre variación funcional y variación neutral. La primera incluye la variación adaptativa, mutaciones genéticas que desempeñan un papel crucial en la adaptación de los animales de granja a su medio ambiente, y la adaptación selectiva, que implica rasgos de interés ganadero como la producción de leche. La adaptación neutral, en cambio, hace referencia a la variación genética que no tiene un efecto aparente en la adaptación o en los rasgos que desea seleccionar. Actualmente, existen varios métodos estadísticos para detectar señales genéticas de adaptación. Los investigadores del proyecto NEUTRADAPT (Estimation of neutral and adaptive/selective genetic variation in farm animal species) emplearon varios de estos métodos para examinar la existencia de señales genéticas de adaptación y domesticación en animales de granja. Esto se llevó a cabo comparando firmas genéticas de selección tanto entre poblaciones que viven en hábitats diferentes como entre el ancestro común y las especies domésticas. Para investigar señales genéticas de adaptación, se estudiaron poblaciones de cabra y de oveja de diversas áreas geográficas de Marruecos, a saber, la costa, las montañas y el desierto. Para estudiar señales genéticas de domesticación, se seleccionaron cabras y ovejas domésticas procedentes de su supuesto centro de domesticación en el norte de Irán y sus homólogos silvestres, los bezoares (Capra aegagrus) y los muflones (Ovis orientalis), respectivamente. Los investigadores detectaron firmas genéticas de selección positiva empleando la técnica de homocigosidad haplotípica extendida (EHH) / puntuación del haplotipo integrado (iHS). Los resultados finales serán comparados con diferentes métodos estadísticos empleados por los socios del proyecto NEXTGEN. Posteriormente, los datos serán publicados a través de artículos en revistas científicas con revisión por pares y describirán la domesticación de la cabra y la oveja y sus adaptaciones a diferentes hábitats. La conservación de recursos genéticos y el control de la endogamia son aspectos clave para llevar a cabo programas de mejora genética eficaces y sostenibles en animales de granja. Por tanto, los investigadores evaluaron y compararon el uso de información molecular para optimizar programas de mejora genética con métodos tradicionales basados en datos de pedigrí. La información molecular fue empleada tanto para estimar la coancestría y determinar la tasa de endogamia como para detectar señales de selección. Los investigadores también analizaron polimorfismos de nucleótido simple (SNP), una variación en la secuencia de ADN, y secuencias de genoma completo. Los SNP comprendían millones de polimorfismos (variaciones individuales dentro de una misma especie). Las estimas de variación genética neutral y adaptativa tendrán una repercusión de gran calado en estudios de biodiversidad y en la mejora genética de poblaciones de ganado. Además, la información puede ser empleada para ayudar a identificar y cuantificar el riesgo de extinción de razas y poblaciones animales. En conjunto, los resultados de NEUTRADAPT pueden ayudar a diseñar programas destinados a conservar los recursos genéticos de razas y poblaciones de animales en peligro de extinción mediante la reducción de la endogamia y la conservación de la variabilidad genética.
Palabras clave
Variación genética, mutación, adaptación selectiva, adaptación neutral, NEUTRADAPT, ancestral, doméstico, Ovis orientalis, Capra aegagrus, polimorfismo de nucleótido simple
