Une bactérie mutée à l'origine d'infections chroniques
P. aeruginosa est une bactérie fréquente dans le sol, l'eau et sur la peau. Elle infecte l'homme tout comme les autres animaux. Son développement dans des organes vitaux comme les poumons est la cause d'infections respiratoires aiguës ou chroniques. Dans le cas de patients atteints d'autres maladies comme la fibrose kystique, une infection par P. aeruginosa peut être souvent fatale. Les variétés de P. aeruginosa isolées chez des patients présentant des infections respiratoires ont montré une formation différente des pigments, du jaune-vert au brun, signe d'un changement génétique. En effet, les P. aeruginosa isolés en milieu clinique présentent des délétions de chromosomes par rapport aux formes normales. Les gènes disparus ont entre autres pour effets de modifier la chimiotaxie des bactéries, leur métabolisme et leur résistance aux antibiotiques. Dans le but d'étudier ces gènes et leur impact sur l'augmentation de la virulence, l'UE a financé le projet PACI («Adaptation of Pseudomonas aeruginosa to the human host during chronic infections»). Les scientifiques ont séquencé le génome des bactéries mutées et les ont soumises à plus de 950 conditions de croissance. Les résultats à ce jour montrent que les isolats produisant le pigment brun présentent des propriétés métaboliques différentes et une meilleure adéquation que les souches sauvages. Les bactéries mutées sont plus sensibles aux antibiotiques à base d'aminoglycoside mais plus résistants à la toxine pyocine AP41. La caractérisation des isolats de P. aeruginosa par PACI déterminera comment certaines mutations contribuent à l'adaptation des bactéries dans un contexte de fibrose kystique, conduisant à des infections chroniques. Le fait de comprendre comment ces bactéries mutées modifient leur physiologie et leur virulence soutiendra la mise au point de nouvelles stratégies de traitement de ces infections chroniques.