Objectif
Pseudomonas aeruginosa (PA) is an important bacterial pathogen causing a wide range of acute and chronic infections (CI). It usually expresses a yellow-green pigment. It is a major cause of respiratory CI in patients with underlying diseases such as cystic fibrosis (CF) leading to a progressive lung damage. Pathogenesis in CI implies a genetic diversification of PA, with emergence of atypical mutants such as brown pigment producing PA (bpPA). PACI study aims to explore the adaptation process of PA in CI, through the example of bpPA and to evaluate the clinical outcome of the emergence of such mutants. Ten clinical (CF and non-CF) or laboratory bpPA, and their isogenic yellow-green counterparts, have been identified. Preliminary data showed a large deletion in the same chromosomal region in bpPA when compared to their parental strains. Deleted genes are involved in chimiotactism, metabolism, resistance to antibiotics, synthesis of lipopolysaccharides, biofilm formation, anaerobic respiration and regulation. This strongly suggests that bpPA deeply modify their behaviour and virulence strategy in patients. The applicant will identify the deleted genes in bpPA using comparative genomic DNA hybridization microarrays and to assess variations in resistance to antibiotics and pyocins, growth under diverse conditions, metabolism, motility and virulence factor production. He will correlate the emergence of bpPA in CF-patients with disease progression using existing clinical data and bacterial collection. This proposal will permit the fellow, now in position of Associate Professor/Hospital Practitioner in the Dpt of Bacteriology, University of Franche-Comté (Besançon, France), to conduct the project during 2 years in the Dpt of Microbiology, University of Washington (Seattle, USA) before resuming his position in France. Characterization of these chronically-adapted clinical isolates will contribute to define new therapeutical options for the treatments of CI due to PA.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IOF-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
25000 Besancon
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.