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Characterizing the effects of the Mediterannean diet on endothelial dysfunction

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Les MITES se font une réputation en régulation génétique

Le déplacement d'éléments génétiques d'un site à l'autre le long du génome permet d'obtenir une situation extrêmement dynamique en termes d'évolution des espèces et de réponse aux maladies. Un projet financé par l'UE a étudié un type particulier de microélément transposable et analysé son influence sur les gènes voisins.

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Les séquences mobiles représentent un moyen très efficace de modification du génome. Ces éléments dits transposables (ou transposons) appelés également gènes sauteurs sont capables de générer de nouvelles mutations par leur positionnement stratégique sur un gène donné. Ils peuvent également être la source de réarrangements chromosomiques. Sachant qu'ils représentent plus de la moitié de l'ADN d'un organisme, il est facile d'imaginer leur importance dans l'expression des gènes, le développement d'un organisme ou l'évolution d'une espèce. Le projet Transplant («Regulation of transposable elements in plants and impact on genome evolution») a donc été mis en place afin d'élucider leur rôle à l'aide de la star des laboratoires, la plante modèle Arabidopsis thaliana ou arabette des dames. Les chercheurs du projet Transplant ont plus particulièrement axé leurs travaux sur les éléments transposables à répétitions inversées miniatures (MITES, pour miniature inverted repeat transposable elements). Présent en grandes quantités dans le génome et trop petits pour être traduits en protéines, les MITES constituent un type bien particulier d'élément transposable dans le génome. Les chercheurs voulaient clarifier l'influence de ces transposons sur l'expression des gènes voisins. Ils voulaient également déterminer si les séquences miniatures jouaient un rôle dans l'organisation du génome. Les chercheurs de Transplant ont développé des outils informatiques appropriés leur permettant d'affiner nos connaissances sur le génome d'Arabidopsis thaliana. L'influence des éléments transposables a également été étudié. Les futures recherches du projet seront axées sur le niveau de méthylation associé à certains MITES sélectionnés afin de confirmer les résultats des données bioinformatiques. Les progrès de la génomique ont été extraordinaires depuis la première proposition d'élucidation du mécanisme complexe de régulation génétique de l'opéron lac il y a cinquante ans. Le potentiel des applications s'appuyant sur le contrôle des éléments transposables est encore plus vaste et balaie tout le champ d'analyse de la structure génomique et de sa régulation.

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