Limpieza en los programas de cría porcina
La revolución de la genómica y las técnicas cartográficas o de mapeo está influyendo muy positivamente en la mejora de casi todos los rasgos relacionados con la productividad que se evalúan en el ganado. Gracias a los avances, los criadores de cerdos y los criadores comerciales de carne porcina tienen ahora acceso a una tecnología de genes marcadores que antes se consideraba del dominio exclusivo de los laboratorios de alta tecnología. El objetivo de los socios del proyecto PIGSNP («SNP de gran utilidad dentro de las razas porcinas comerciales europeas») era delimitar la búsqueda de características útiles en las razas porcinas comerciales utilizando una novedosa técnica que localiza polimorfismos de nucleótido simple (SNP). Como su nombre indica, los SNP ocurren cuando sólo hay diferencias de un nucleótido o de un par de bases en la cadena de ADN. Las implicaciones de la identificación de SNP son realmente importantes. Dado que las variaciones que se encuentran en los genomas de todas las especies son enormes, dicha técnica permite a los criadores de animales y plantas adaptar sus programas a medida para obtener la receta exacta de los rasgos requeridos. Los socios de PIGSNP estudiaron 158 muestras de ADN recogidas a partir de 5 de las principales razas porcinas: Duroc, Pietrain, Landrace, Large White (gran cerdo blanco) y jabalí (WB). Para ello se sirvieron de la tecnología de secuenciación de alto rendimiento de Illumina Solex que, al ofrecer una gran superficie, posibilita la realización de muchos miles de reacciones químicas en paralelo. Así aislaron con un alto grado de confianza más de 350 000 SNP que, junto con polimorfismos procedentes de otras fuentes, sirvieron para construir una base de datos con más de 500 000 SNP. A continuación emplearon la tecnología de genotipado del chip de de microesferas de alta densidad («beadchip») PorcineSNP60 para validar los SNP y determinar su valor genético, lo que les permitió identificar unos 43 000 SNP que se han puesto a libre disposición de la comunidad científica con fines de investigación. De este total, casi 4 500 han sido confirmados como específicos de una raza en particular. Desde una perspectiva práctica, un rasgo genético que los criadores desean eliminar es el olor sexual, debido a ciertas hormonas anabólicas testiculares, que confiere un sabor desagradable a la carne. Así pues, el beadchip se utilizó para genotipar a los cerdos conforme a su posible olor sexual. El uso de marcadores genéticos elimina la necesidad de castrar a los animales, que era hasta la fecha la única manera de asegurarse de que la carne no tuviera un sabor desagradable. Aunque habrá que seguir analizando y anotando el genoma del cerdo para poder señalar los genes precisos que subyacen a los rasgos no deseados, el beadchip PorcineSNP60 diseñado en el marco del proyecto PIGSNP tiene una utilidad práctica innegable en la industria de la cría de cerdos. La extensión de los límites del genotipado a la detección de un solo nucleótido sin duda se puede reproducir en otros programas de mejoramiento genético y al estudio del genoma en general.
