De nouveaux composés antibactériens
Les antibiotiques interfèrent avec une fonction bactérienne donnée pour empêcher la croissance et la diffusion. C'est ainsi que les antibiotiques des types aminocoumarine et cyclothialidine, produits par Streptocymes, inhibent l'activité de l'ADN gyrase, une enzyme nécessaire au maintien de la structure de l'ADN. Le projet Combigyrase («Development of new gyrase inhibitors by combinatorial biosynthesis») financé par l'UE s'est appuyé sur l'expertise européenne dans ce domaine pour étudier et mettre au point de nouveau médicaments, très attendus. Le projet avait pour but d'élargir et de diversifier les puissants inhibiteurs naturels des gyrases, grâce à la biosynthèse combinatoire. La biosynthèse combinatoire est une nouvelle méthode qui utilise les manipulations génétiques pour améliorer les propriétés chimiques et l'activité pharmacologique de composés naturels. Elle consiste à produire de nouveaux métabolites en modifiant l'ensemble de gènes responsable de la production de l'antibiotique et en l'introduisant dans des souches appropriées de Streptomyces. Les partenaires du projet ont pu identifier et isoler des gènes de microorganismes produisant des antibiotiques très puissants du type cyclothialidine. L'analyse de la séquence de l'ADN cloné a permis d'identifier plusieurs gènes de synthèse peptidique non-ribosomale ainsi que la séquence requise pour la cyclothialidine et les intermédiaires biosynthétiques. Les chercheurs ont également identifié un gène qui pourrait modifier la biosynthèse de la cyclothialidine. La biosynthèse combinatoire utilisée par le projet Combigyrase est une méthode prometteuse pour concevoir de nouveaux composés antibactériens, et donc très utile dans la lutte contre la résistance aux antibiotiques.
