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Program developing interdisciplinary research POtential for the STudies of BIOMolecular INteractions

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Soutien des recherches tchèques sur les interactions biomoléculaires

La biologie structurelle cherche à comprendre les mécanismes régissant la conformation tridimensionnelle des biomolécules. La connaissance précise des interactions biomoléculaires est absolument nécessaire si l''on veut comprendre les mécanismes biologiques fondamentaux et développer des applications thérapeutiques.

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Le Centre national de recherche biomoléculaire (CNRB) de République tchèque est devenu l''un des laboratoires de pointe en Europe centrale dans le domaine de la biologie structurelle. Les recherches du Centre sont actuellement axées sur la caractérisation structurelle de plusieurs macromolécules fondamentales et ces travaux ont obtenu le soutien financier de diverses organisations de financement nationales et européennes. Les partenaires du projet POSTBIOMIN («Program developing interdisciplinary research potential for the studies of biomolecular interactions»), financé par l''UE, ont tenté d''élargir le domaine de recherche du CNRB à l''étude des interactions biomoléculaires. Ces efforts se sont tout d''abord matérialisés sous la forme d''un recrutement d''experts étrangers et l''organisation de cours doctoraux et de conférences internationales, contribuant ainsi à la formation de ses étudiants à des carrières dans les instituts de recherche modernes et les industries privées. Le projet POSTBIOMIN a également permis de cofinancer des investissements en capacité de recherche comme par exemple le projet EU CEITEC de l''Institut technologique d''Europe centrale (CEITEC). Les travaux du projet devaient renforcer la capacité de réseautage régionale et européenne du Centre dans le domaine des sciences de la vie et assurer la formation de partenariats stratégiques avec d''autres équipes de recherche. Les partenaires de POSTBIOMIN se sont intéressés aux recherches sur la réparation de l''ADN et plus particulièrement à celles cherchant à identifier les détails moléculaires de la recombinaison homologue et la réparation des doubles brins d''ADN (ADNdb). Les ruptures de l''ADN double brin sont impliquées dans certains cancers et sont le résultat d''un dysfonctionnement de processus endogènes comme la réplication de brins d''ADN endommagés ou de facteurs exogènes comme les composés chimiques génotoxiques et les rayonnements ionisants. La caractérisation du processus de réparation des ruptures de l''ADN double brin a été obtenue par l''étude des interactions fonctionnelles et physiques de plusieurs protéines comme Rad54 et Srs2. Les chercheurs ont accordé une attention toute particulière au rôle joué par les modifications post-traductionnelles des protéines et plus spécialement au processus de sumoylation qui, grâce à l''addition post-traductionnelle de petits peptides appelés SUMO (pour small ubiqutin related modifier) modifie le fonctionnement des protéines. Le projet POSTBIOMIN a également soutenu les recherches du centre dans le domaine du contrôle qualité de l''ARN et des processus de reconnaissance et d''interactions hôte-pathogène. En utilisant la spectroscopie RMN, les chercheurs ont pu décrypter la structure de certains complexes ARN-protéines, spécialement ceux impliqués dans le contrôle qualité de l''ARN comme le complexe TRAMP. Considérant l''importance de ce complexe multi-protéique, les chercheurs ont généré des mutants spécifiques afin de déterminer le rôle de chaque composant du complexe TRAMP dans le contrôle qualité de l''ARN. Le rôle central des lectines, des protéines liées aux glucides, dans plusieurs processus physiologiques comme la réaction inflammatoire est relativement bien connu. Des travaux financés par le projet POSTBIOMIN se sont intéressés à la compréhension des interactions hôte-pathogène induites par cette reconnaissance protéine-glucide. Le décryptage de ce processus permettrait d''inhiber par exemple, l''adhésion des pathogènes à leur hôte et la formation de biofilms résistants aux antibiotiques. Dans l''ensemble, le projet POSTBIOMIN a parfaitement réussi à élargir les capacités de recherche du Centre, promesse de nouvelles découvertes et d''innovation. Ses activités ont également eu des répercussions sur le potentiel de R&D de la République tchèque améliorant ainsi ses possibilités de collaboration avec l''industrie et son attractivité pour de nouveaux investisseurs.

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