Sostenere la ricerca sull'interazione biomolecolare in Cechia
Il National Centre for Biomolecular Research (NCBR) nella Repubblica ceca è diventato uno dei principali laboratori di biologia strutturale in Europa centrale. Attualmente la principale attività dell'istituto è la caratterizzazione strutturale di varie macromolecole, e ha ricevuto finanziamenti extrauniversitari da vari enti di finanziamento europei e nazionali. I partner che lavorano al progetto POSTBIOMIN ("Program developing interdisciplinary research potential for the studies of biomolecular interactions"), finanziato dall'UE, hanno cercato di ampliare il focus della ricerca dell'NCBR per studiare le interazioni biomolecolari. Ciò si è concretizzato con il reclutamento di esperti stranieri e l'organizzazione di corsi di dottorato e conferenze, contribuendo così anche alla formazione per l'occupazione in istituti e aziende moderni di ricerca. Ulteriori misure di supporto da parte di POSTBIOMIN hanno incluso il cofinanziamento degli investimenti nella capacità di ricerca con il progetto UE CEITEC del Central European Institute of Technology (CEITEC). Le attività del progetto dovevano rafforzare la capacità di networking a livello regionale ed europeo del Centro nel settore delle scienze della vita, e contribuire alla formazione di partnership strategiche con altri team di ricerca. POSTBIOMIN si è concentrato sulla ricerca che si occupa della riparazione del DNA danneggiato, e in particolare sulla determinazione dei dettagli molecolari della ricombinazione omologa e delle rotture delle doppie eliche (DSB). Le DSB del DNA sono coinvolte nel cancro e sono causate sia dal mancato funzionamento di processi endogeni quali la replicazione di un modello danneggiato di DNA sia da agenti esogeni, incluse sostanze chimiche genotossiche o radiazioni ionizzanti. La caratterizzazione del processo di riparazione delle DSB è stata ottenuta analizzando le interazioni funzionali e fisiche di varie proteine quali Rad54 e Srs2. Particolare importanza è stata data al ruolo delle modifiche post-traslazionali delle proteine tramite l'aggiunta di piccoli peptidi modificatori ubiquitina-simili (SUMO). Le attività di ricerca dell'NCBR sostenute dal progetto POSTBIOMIN hanno incluso anche lo studio approfondito del processo di controllo di qualità dell'RNA e del riconoscimento e delle interazioni tra patogeno e ospite. Utilizzando la spettroscopia NMR gli scienziati sono riusciti a svelare la struttura dei complessi proteina-RNA, con particolare attenzione alle proteine coinvolte nel controllo di qualità dell'RNA. Considerata l'importanza del complesso multiproteico TRAMP, sono stati creati specifici mutanti per delineare il ruolo di ogni componente di TRAMP nel controllo di qualità dell'RNA. Il ruolo centrale delle proteine che legano i carboidrati (lectine) in vari processi fisiologici incluse le risposte infiammatorie è ben noto. Le attività di ricerca finanziate da POSTBIOMIN si sono indirizzate a comprendere in che modo il riconoscimento tra proteine e carboidrati faccia da tramite con il riconoscimento tra patogeno e ospite. Scomporre questo processo aiuterebbe l'inibizione dell'adesione dei patogeni e della formazione dei biofilm resistenti agli antibiotici. In generale POSTBIOMIN è riuscito ad ampliare la capacità di ricerca dell'NCBR, portando a nuove scoperte e innovazioni della ricerca. Le sue attività hanno anche influenzato il potenziale di ricerca e sviluppo (R&S) della Repubblica Ceca, potenziando così le collaborazioni di ricerca con l'industria e attirando ulteriori investimenti.
