Wsparcie czeskich badań w zakresie interakcji biomolekularnych
Krajowe Centrum Badań Biomolekularnych (NCBR) w Czechach stało się jednym z wiodących laboratoriów specjalizujących się w biologii strukturalnej w Europie. Obecnie prace instytutu zmierzają do opracowania charakterystyki strukturalnej różnych makrocząsteczek. Prace te uzyskały zewnętrzne dofinansowanie z różnych europejskich i krajowych organów odpowiedzialnych za finansowanie. Partnerzy pracujący w finansowanym ze środków UE projekcie POSTBIOMIN ("Program developing interdisciplinary research potential for the studies of biomolecular interactions") dążyli do rozszerzania zakresu badań NCBR o zbadanie interakcji biomolekularnych. Udało się to zrealizować poprzez zaproszenie do projektu zagranicznych ekspertów oraz organizację międzynarodowych wykładów i studiów doktoranckich. Przełożyło się to również na podniesienie kwalifikacji pracowników zatrudnionych w nowoczesnych instytucjach i firmach badawczych. Dalsze wsparcie w ramach projektu POSTBIOMIN uwzględniało współfinansowanie, wraz z Środkowoeuropejskim Instytutem Technologicznym poprzez projekt EU CEITE, inwestycji w możliwości badawcze. Działania podejmowane w projekcie miały na celu wzmocnienie możliwości współpracy Centrum na poziomie regionalnym oraz europejskim w zakresie nauk przyrodniczych oraz pomoc w utworzeniu strategicznej współpracy partnerskiej z innymi zespołami badawczymi. W projekcie POSTBIOMIN skoncentrowano się na badaniach dotyczących naprawy uszkodzonego kodu DNA, a zwłaszcza na określeniu szczegółów molekularnych rekombinacji homologicznej i naprawie uszkodzenia obu nici (DSB). DSB kodu DNA związane są z chorobą nowotworową i wynikają z niepowodzenia procesów endogennych, takich jak replikacja uszkodzonego szablonu DNA, oraz czynników egzogennych, takich jak genotoksyczne związki chemiczne lub promieniowanie jonizujące. Charakterystykę procesu naprawy DSB opracowano dzięki badaniom funkcjonalnych i fizycznych reakcji różnych protein, takich jak Rad54 i Srs2. Szczególny nacisk położono na rolę modyfikacji posttranslacyjnych białek poprzez dodanie małego peptydowego modyfikatora podobnego do ubikwityny (SUMO). Co więcej, działania badawcze NCBR wspierane w ramach projektu POSTBIOMIN uwzględniły analizę procesu kontroli jakości RNA oraz rozpoznanie i interakcje pomiędzy patogenem i gospodarzem. Wykorzystując spektroskopię NMR, naukowcy mogli określić strukturę kompleksów białkowych i RNA oraz skupić się zwłaszcza na proteinach biorących udział w kontroli jakości RNA. Biorąc pod uwagę znaczenie wielobiałkowego kompleksu TRAMP, utworzono określone mutacje w celu wyznaczenia roli każdego komponentu TRAMP w kontroli jakości RNA. Naukowcy dobrze znają główną rolę białek wiążących węglowodany oraz lektyn w różnych procesach fizjologicznych, w tym w reakcjach zapalnych. Działania badawcze finansowane w ramach projektu POSTBIOMIN zmierzały do zrozumienia, w jaki sposób rozpoznanie białek i węglowodanów pośredniczy w rozpoznaniu patogenu i gospodarza. Dogłębna analiza tego procesu pomoże zahamować adhezję patogenów i tworzenie się antybiotykoopornych błon biologicznych. Reasumując, projekt POSTBIOMIN z powodzeniem rozszerzył możliwości badawcze NCBR, prowadząc do nowych wniosków badawczych i innowacji. Działania projektu miały również wpływ na możliwości w zakresie badań i rozwoju (R&D) Czech, poprawiając tym samym współpracę z sektorem oraz zachęcając do dalszych inwestycji.
