La séquence génomique du virus de la grippe affecte sa pathogénicité
Étant donné sa capacité à franchir la barrière des espèces, de nouveaux types de virus de la grippe présentant des propriétés pathogènes différentes pourraient apparaître rapidement. Il est extrêmement important de rapidement identifier les virus de la grippe qui sont hautement pathogènes ou se transmettent facilement entre humains dès le début de l'épidémie. L'objectif du projet RNAFLU («Effect of natural viral RNA sequence variation on influenza virus RNA function») financé par l'UE était d'étudier si les mutations introduites dans le génome du virus de la grippe pouvaient affecter la fonction même de l'ARN du virus, indépendamment de l'effet sur les protéines virales. L'hypothèse de travail était que ce genre de mutation pourrait indirectement affecter la capacité du virus à se répliquer dans les cellules humaines, affectant ainsi les propriétés pathogènes du virus de la grippe ou sa capacité à s'adapter chez de nouvelles espèces hôtes. Dans ce contexte, les chercheurs ont décidé de déterminer si les mutations naturelles affectaient les propriétés et les fonctions importantes de l'ARN viral telles que la structure du microARN (ARNm), l'épissage, la liaison à des ARNm cellulaires ou la traduction des ARNm. Ils ont constaté que les molécules dérivées des virus de la grippe présentant différentes propriétés pathogènes ou différents tropismes d'espèces avaient des propriétés différentes et une structure secondaire. En outre, les sites de liaison bien conservés pour les ARNm cellulaires ont été identifiés dans les ARNm du virus de la grippe qui inhibait l'expression du virus. Le traitement des ARNm viral de la grippe ont révélé de grandes différences au niveau de l'efficacité de l'épissage, qui pourrait affecter le rapport entre les protéines impliquées dans la phatogénicité du virus. Globalement, les résultats de RNAFLU remettent en cause la perception actuelle selon laquelle la variation dans la séquence d'ARN du virus de la grippe affecte principalement les protéines virales. Les résultats montrant que les différences au niveau de la séquence d'ARN de la grippe affectent la fonction même de l'ARN et ont un impact sur la phatogénicité du virus ont fourni de nouvelles informations quant aux mécanismes de la phatogénicité du virus de la grippe. Ces connaissances pourraient permettre de contrôler la transmission du virus, et par là même de minimiser les risques d'une pandémie de grippe.
