Sélectionner les meilleures données sur les mutations murines
L'induction de mutations ciblées, des changements précis et stables du code génétique, aide à mieux comprendre le fonctionnement génétique et à générer des modèles pour de nombreuses maladies, dont le cancer. L'International Knockout Mouse Consortium (IKMC) a été créé pour coordonner différents projets nationaux déjà en cours dans le domaine de la mutagenèse murine. Le projet I-DCC (The international data coordination centre), financé par l'UE, a été établi pour offrir un point d'entrée unique pour toutes les ressources de l'IKMC. I-DCC offre des informations pour toutes les lignées cellulaires de souris mutantes d'IKMC contenues dans des inventaires dans le monde entier par un site web consacré. Ce site contient une liste principale consultable de tous les gènes de souris, de la structure moléculaire des allèles knock-out et des liens vers les inventaires qui distribuent des cellules et des souris knock-out. L'IKMC a coordonné une approche internationale reflétée par la taille des résultats des grands programmes de mutagenèse comme EUCOMM (European Conditional Mouse Mutagenesis Program) et KOMP (Knockout Mouse Project). L'élimination des pratiques redondantes et la production de 18 000 cellules souches embryonnaires (CSE) knockout ont facilité la recherche sur le génome de ce petit mammifère. De plus, l'I-DCC intègre d'autres informations scientifiques pertinentes comme des données de phénotypes de souris et une base de données consultable. Le site web reçoit plus de 15 000 visites chaque mois, ce qui démontre clairement le succès du projet. L'un des objectifs de l'IMPC (International Mouse Phenotyping Consortium) est de produire des souris à partir des CSE pour procéder à leur phénotypage. L'I-DCC a développé des interfaces pour coordonner cette initiative. En fusionnant les sites de l'IKMC et de l'IMPC, la maintenance et la présentation des données de l'IKMC a été sauvegardée pour un futur proche. Les services fournis par l'IMPC satisfont les besoins de la communauté biomédicale entière ainsi que du public et de la communauté pour des informations génétiques fonctionnelles. Les utilisateurs sont même en mesure d'enregistrer un gène qui les intéresse et peuvent recevoir une notification lorsque des informations pertinentes sont disponibles. Les applications de cette ressource sont vastes et vont du fonctionnement génétique fondamental à la biofabrication, en passant par l'industrie pharmaceutique, l'agriculture et la biomédecine. Les programmes coordonnés à grande échelle de ce type devraient aider les entités de recherche nationales à rassembler leurs ressources et à éviter toute répétition.
Mots‑clés
Mutation murine, mutagenèse, génome de mammifère, phénotype, IMPC
