Marine Biodiversity as Sustainable Resource of Disease-Suppressive Microbes and Bioprotectants for Aquaculture and Crop Diseases

Información del proyecto

MARBLES

Identificador del acuerdo de subvención: 101000392

DOI

10.3030/101000392

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 21 Abril 2021

Fecha de inicio 1 Mayo 2021

Fecha de finalización 30 Abril 2026

Financiado con arreglo a

• SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy

Coste total

€ 7 496 896,25

Aportación de la UE

€ 7 496 896,25

Coordinado por

UNIVERSITEIT LEIDEN
Netherlands

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Resultado final

Other (1)

Portfolio of Promotional Material

Publicaciones

Peer reviewed articles (22)

Chemical richness and diversity of uncultivated ‘Entotheonella’ symbionts in marine sponges

Autores: Maria Dell, Masato Kogawa, Alena B. Streiff, Taro Shiraishi, Alessandro Lotti, Christoph M. Meier, Michelle A. Schorn, Christopher Field, Jackson K. B. Cahn, Hiromi Yokoyama, Yuito Yamada, Eike Peters, Yoko Egami, Yu Nakashima, Karen Co Tan, Christian Rückert, Mohammad Alanjary, Jörn Kalinowski, Tomohisa Kuzuyama, Paco Cardenas, Shirley Pomponi, Detmer Sipkema, Amy Wright, Kentaro Takada, Ikuro
Publicado en: Nature Chemical Biology, Edición 22, 2026, Página(s) 217-228, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-025-02066-0

antiSMASH 8.0: extended gene cluster detection capabilities and analyses of chemistry, enzymology, and regulation

Autores: Kai Blin, Simon Shaw, Lisa Vader, Judit Szenei, Zachary L Reitz, Hannah E Augustijn, José D D Cediel-Becerra, Valérie de Crécy-Lagard, Robert A Koetsier, Sam E Williams, Pablo Cruz-Morales, Sopida Wongwas, Alejandro E Segurado Luchsinger, Friederike Biermann, Aleksandra Korenskaia, Mitja M Zdouc, David Meijer, Barbara R Terlouw, Justin J J van der Hooft, Nadine Ziemert, Eric J N H
Publicado en: Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf334

Novel types of RiPP-modifying enzymes

Autores: Richter, D., & Piel, J.
Publicado en: Current Opinion in Chemical Biology, Edición 80, 102463, 2024, ISSN 1367-5931
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2024.102463

An actionable guide to the United Nations' Biodiversity Beyond National Jurisdiction Agreement for research scientists

Autores: Jeffrey Marlow, Arianna Broggiato, Janine Felson, Harriet Harden‐Davies, Rebecca Helm, Marcel Jaspars
Publicado en: Limnology and Oceanography, Edición 71, 2026, Página(s) (1), ISSN 0024-3590
Editor: American Society of Limnonogy and Oceanography
DOI: 10.1002/lno.70274

New insights into the microbiome of the deep-sea sponge Inflatella pellicula and the secondary metabolic potential of metagenome-assembled genomes and the wider microbiome

Autores: Stephen A. Jackson, Pavlo Hrab, Mitja M. Zdouc, David J. Clarke, Alan D.W. Dobson
Publicado en: Microbial Genomics, Edición 12, 2026, Página(s) (1), ISSN 2057-5858
Editor: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001602

Marine microbial enzymes as potential antibiofilm agents: expanding the arsenal of bioactive agents targeting biofilm-forming microorganisms

Autores: Anna Luiza Bauer Canellas, Gabriel Rodrigues Dias, Isabelle Rodrigues Lopes, Jéssyca Freitas-Silva, Alan D. W. Dobson, Marinella Silva Laport, Bruno Francesco Rodrigues de Oliveira
Publicado en: Critical Reviews in Microbiology, 2025, Página(s) 1-18, ISSN 1040-841X
Editor: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/1040841x.2025.2510247

Desferrioxamine Sharing among Microalgae-Associated Bacteria Enhances Iron-Limited Inhibition of <i>Vibrio anguillarum</i>

Autores: Dóra Smahajcsik, Mille Rask Sander, Matilde Emídio Almeida, Patricia Arias-Orozco, Jette Melchiorsen, Daniel J. Otto, Lone Gram, Scott A. Jarmusch
Publicado en: Journal of Natural Products, Edición 89, 2026, Página(s) 955-965, ISSN 0163-3864
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jnatprod.5c01565

Stronger together: harnessing natural algal communities as potential probiotics for inhibition of aquaculture pathogens

Autores: Dóra Smahajcsik, Line Roager, Mikael Lenz Strube, Sheng-Da Zhang, Lone Gram
Publicado en: Microbiology Spectrum, 2025, ISSN 2165-0497
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/spectrum.00421-25

Probiotic potential of Isochrysis galbana microbiomes against the fish pathogen Vibrio anguillarum

Autores: Matilde Emídio Almeida, Dóra Smahajcsik, Shengda Zhang, Lone Gram
Publicado en: Aquaculture, Edición 612, 2025, Página(s) 743196, ISSN 0044-8486
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.aquaculture.2025.743196

Comparative Metagenomic Analysis of Biosynthetic Diversity across Sponge Microbiomes Highlights Metabolic Novelty, Conservation, and Diversification

Autores: Loureiro, C., Galani, A., Gavriilidou, A., Chaib de Mares, M., van der Oost, J., Medema, M. H., & Sipkema, D.
Publicado en: MSystems, Edición 00219193, 2022, ISSN 0021-9193
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00357-22

Correction: Unpacking policy developments in marine natural product research: a scientist's guide to DSI and BBNJ

Autores: Federica Casolari, Amelia Westmoreland, Thomas Vanagt, Marcel Jaspars
Publicado en: Natural Product Reports, Edición 42, 2025, Página(s) 1909-1909, ISSN 0265-0568
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d5np90039e

Biosynthetic potential of the global ocean microbiome

Autores: Paoli, L., Ruscheweyh, H. J., Forneris, C. C., Hubrich, F., Kautsar, S., Bhushan, A., Lotti, A., Clayssen, Q., Salazar, G., Milanese, A., Carlström, C. I., Papadopoulou, C., Gehrig, D., Karasikov, M., Mustafa, H., Larralde, M., Carroll, L. M., Sánchez, P., Zayed, A. A., Cronin, D.R., Acinas, S.G., Bork, P., Bowler, C., Delmont, T.O., Gasol, J.M., Gossert, A.D., Kahles, A., Sullivan, M.B., Wincke
Publicado en: Nature, Edición 607, 2022, Página(s) 111–118, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04862-3

From friends to foes: fungi could be emerging marine sponge pathogens under global change scenarios

Autores: Pérez-Llano Y, Yarzábal Rodríguez LA, Martínez-Romero E, Dobson ADW, Gunde-Cimerman N, Vasconcelos V and Batista-García RA.
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 14:1213340, 2023, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2023.1213340

Non-targeted metabolomics-based molecular networking enables the chemical characterization of Rumex sanguineus, a wild edible plant

Autores: Valentina Ramundi, Mitja M. Zdouc, Enrica Donati, Justin J. J. van der Hooft, Sara Cimini, Laura Righetti
Publicado en: Metabolomics, Edición 21, 2025, ISSN 1573-3890
Editor: Springer Science+Business Media
DOI: 10.1007/s11306-024-02210-2

Host Evolutionary History Drives Prokaryotic Diversity in the Globally Distributed Sponge Family Petrosiidae

Autores: N. van der Windt, B. Paix, J. C. Biesmeijer, R. Ambo‐Rappe, Y. M. Huang, K. G. S. Nirbadha, D. Sipkema, N. J. de Voogd
Publicado en: Molecular Ecology, 2025, ISSN 0962-1083
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.70186

Metabolome-guided genome mining of RiPP natural products.

Autores: Zdouc, M. M., van der Hooft, J.J.J. and Medema, M.H.
Publicado en: Trends in Pharmacological Sciences, 2023, ISSN 0165-6147
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tips.2023.06.004

MIBiG 3.0: a community-driven effort to annotate experimentally validated biosynthetic gene clusters.

Autores: Barbara R Terlouw 1 , Kai Blin 2 , Jorge C Navarro-Muñoz 1 3 , Nicole E Avalon 4 , Marc G Chevrette 5 , Susan Egbert 6 , Sanghoon Lee 7 , David Meijer 1 , Michael J J Recchia 7 , Zachary L Reitz 1 , Jeffrey A van Santen 7 8 , Nelly Selem-Mojica 9 , Thomas Tørring 10 , Liana Zaroubi 7 , Mohammad Alanjary 1 , Gajender Aleti 11 , César Aguilar 12 , Suhad A A A
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 51 (D1), 2022, Página(s) D603–D610, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac1049

Unpacking policy developments in marine natural product research: a scientist's guide to DSI and BBNJ

Autores: Federica Casolari, Amelia Westmoreland, Thomas Vanagt, Marcel Jaspars
Publicado en: Natural Product Reports, 2025, ISSN 0265-0568
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4np00070f

MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration

Autores: Mitja M Zdouc, Kai Blin, Nico L L Louwen, Jorge Navarro, Catarina Loureiro, Chantal D Bader, Constance B Bailey, Lena Barra, Thomas J Booth, Kenan A J Bozhüyük, José D D Cediel-Becerra, Zachary Charlop-Powers, Marc G Chevrette, Yit Heng Chooi, Paul M D’Agostino, Tristan de Rond, Elena Del Pup, Katherine R Duncan, Wenjia Gu, Novriyandi Hanif, Eric J N Helfrich, Matthew Jenner, Yoh
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 53, 2025, Página(s) D678-D690, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae1115

Integrated Omics-Based Discovery of Bioactive Halogenated Metabolites from the Deep-Sea Streptomyces sp. B188M101

Autores: Emmanuel Tope Oluwabusola, Stephen A. Jackson, Cristina Brunati, Stefanie Gackstatter, Hannah Vedder, Marianna Iorio, Gargee Chawande, Lekha Menon Margassery, Giang-Son Nguyen, David J. Clarke, Rainer Ebel, Marcel Jaspars, Alan D. W. Dobson
Publicado en: Marine Drugs, Edición 23, 2025, Página(s) 362, ISSN 1660-3397
Editor: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/md23090362

Olive mill solid waste induces beneficial mushroom-specialized metabolite diversity revealed by computational metabolomics strategies

Autores: Soliman Khatib, Idan Pereman, Elizabeth Kostanda, Mitja M. Zdouc, Nirit Ezov, Ron Schweitzer, Justin J. J. van der Hooft
Publicado en: Metabolomics, Edición 21, 2025, ISSN 1573-3890
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s11306-025-02257-9

Improving the odds: Artificial intelligence and the great plate count anomaly

Autores: Detmer Sipkema
Publicado en: Microbial Biotechnology, Edición 17, 2024, ISSN 1751-7915
Editor: Wiley
DOI: 10.1111/1751-7915.70004

Non-peer reviewed articles (2)

FERMO: a Dashboard for Streamlined Rationalized Prioritization of Molecular Features from Mass Spectrometry Data.

Autores: Zdouc, M. M., Bayona Maldonado, L. M., Augustijn, H. E., Soldatou, S., de Jonge, N., Jaspars, M., van Wezel, G. P., Medema, M. H., & van der Hooft, J. J. J.
Publicado en: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Editor: xx
DOI: 10.1101/2022.12.21.521422

The Minimum Information about a Tailoring Enzyme/Maturase data standard for capturing natural product biosynthesis

Autores: Zdouc, M. M., Meijer, D., Biermann, F., Holme, J., Korenskaia, A., Lien, A., Louwen, N. L. L., Navarro-Muñoz, J. C., Nguyen, G., Rutz, A., Sveshnikova, A., Szenei, J., Terlouw, B., Ortega, R. T., Feuermann, M., Bridge, A. J., Van Der Hooft, J. J. J., Weber, T., Ziemert, N., . . . Medema, M. H.
Publicado en: Biological and Medicinal Chemistry, 2024, ISSN 2573-2293
Editor: ChemRxiv
DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-78mtl

Other (1)

Disclosing and Sharing Genetic Resources: Recommendations based on the WIPO Treaty and BBNJ Agreement

Autores: Abbe E. l. Brown
Publicado en: 2024
Editor: n/a

Monographic books (1)

Decoding Marine Genetic Resource Governance Under the BBNJ Agreement

Autores: F. Humphries (Ed.)
Publicado en: Sustainable Development Goals Series, 2025
Editor: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-72100-7