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Marine Biodiversity as Sustainable Resource of Disease-Suppressive Microbes and Bioprotectants for Aquaculture and Crop Diseases

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Pubblicazioni

Novel types of RiPP-modifying enzymes

Autori: Richter, D., & Piel, J.
Pubblicato in: Current Opinion in Chemical Biology, Numero 80, 102463, 2024, ISSN 1367-5931
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2024.102463

Comparative Metagenomic Analysis of Biosynthetic Diversity across Sponge Microbiomes Highlights Metabolic Novelty, Conservation, and Diversification

Autori: Loureiro, C., Galani, A., Gavriilidou, A., Chaib de Mares, M., van der Oost, J., Medema, M. H., & Sipkema, D.
Pubblicato in: MSystems, Numero 00219193, 2022, ISSN 0021-9193
Editore: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00357-22

Biosynthetic potential of the global ocean microbiome

Autori: Paoli, L., Ruscheweyh, H. J., Forneris, C. C., Hubrich, F., Kautsar, S., Bhushan, A., Lotti, A., Clayssen, Q., Salazar, G., Milanese, A., Carlström, C. I., Papadopoulou, C., Gehrig, D., Karasikov, M., Mustafa, H., Larralde, M., Carroll, L. M., Sánchez, P., Zayed, A. A., Cronin, D.R., Acinas, S.G., Bork, P., Bowler, C., Delmont, T.O., Gasol, J.M., Gossert, A.D., Kahles, A., Sullivan, M.B., Wincke
Pubblicato in: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04862-3

From friends to foes: fungi could be emerging marine sponge pathogens under global change scenarios

Autori: Pérez-Llano Y, Yarzábal Rodríguez LA, Martínez-Romero E, Dobson ADW, Gunde-Cimerman N, Vasconcelos V and Batista-García RA.
Pubblicato in: Frontiers in Microbiology, Numero 14:1213340, 2023, ISSN 1664-302X
Editore: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2023.1213340

Metabolome-guided genome mining of RiPP natural products.

Autori: Zdouc, M. M., van der Hooft, J.J.J. and Medema, M.H.
Pubblicato in: Trends in Pharmacological Sciences, 2023, ISSN 0165-6147
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tips.2023.06.004

MIBiG 3.0: a community-driven effort to annotate experimentally validated biosynthetic gene clusters.

Autori: Barbara R Terlouw 1 , Kai Blin 2 , Jorge C Navarro-Muñoz 1 3 , Nicole E Avalon 4 , Marc G Chevrette 5 , Susan Egbert 6 , Sanghoon Lee 7 , David Meijer 1 , Michael J J Recchia 7 , Zachary L Reitz 1 , Jeffrey A van Santen 7 8 , Nelly Selem-Mojica 9 , Thomas Tørring 10 , Liana Zaroubi 7 , Mohammad Alanjary 1 , Gajender Aleti 11 , César Aguilar 12 , Suhad A A A
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2022, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac1049

FERMO: a Dashboard for Streamlined Rationalized Prioritization of Molecular Features from Mass Spectrometry Data.

Autori: Zdouc, M. M., Bayona Maldonado, L. M., Augustijn, H. E., Soldatou, S., de Jonge, N., Jaspars, M., van Wezel, G. P., Medema, M. H., & van der Hooft, J. J. J.
Pubblicato in: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Editore: xx
DOI: 10.1101/2022.12.21.521422

The Minimum Information about a Tailoring Enzyme/Maturase data standard for capturing natural product biosynthesis

Autori: Zdouc, M. M., Meijer, D., Biermann, F., Holme, J., Korenskaia, A., Lien, A., Louwen, N. L. L., Navarro-Muñoz, J. C., Nguyen, G., Rutz, A., Sveshnikova, A., Szenei, J., Terlouw, B., Ortega, R. T., Feuermann, M., Bridge, A. J., Van Der Hooft, J. J. J., Weber, T., Ziemert, N., . . . Medema, M. H.
Pubblicato in: Biological and Medicinal Chemistry, 2024, ISSN 2573-2293
Editore: ChemRxiv
DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-78mtl

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