From Foundations of Phylodynamics to New Applications in Cell Biology

Informations projet

PhyCogy

N° de convention de subvention: 101001077

DOI

10.3030/101001077

Date de signature de la CE 20 Janvier 2021

Date de début 1 Juin 2021

Date de fin 31 Mai 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 999 540,00

Contribution de l’UE

€ 1 999 540,00

Coordonné par

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Switzerland

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Data Management Plan DMP

Publications

Peer reviewed articles (3)

TiDeTree: a Bayesian phylogenetic framework to estimate single-cell trees and population dynamic parameters from genetic lineage tracing data

Auteurs: Sophie Seidel; Tanja Stadler
Publié dans: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 1986, 2022, ISSN 0962-8452
Éditeur: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rspb.2022.1844

Robust Phylodynamic Analysis of Genetic Sequencing Data from Structured Populations

Auteurs: Jérémie Scire, Joëlle Barido-Sottani, Denise Kühnert, Timothy G. Vaughan, Tanja Stadler
Publié dans: Viruses, 2022, ISSN 1999-4915
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v14081648

HIV co-infection is associated with reduced Mycobacterium tuberculosis transmissibility in sub-Saharan Africa

Auteurs: Etthel M. Windels, Eddie M. Wampande, Moses L. Joloba, W. Henry Boom, Galo A. Goig, Helen Cox,Jerry Hella, Sonia Borrell, Sebastien Gagneux, Daniela Brites, Tanja Stadler
Publié dans: PLOS Pathogens, 2024, ISSN 1553-7374
Éditeur: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011675

Other (4)

Integrating Transmission Dynamics and Pathogen Evolution Through a Bayesian Approach

Auteurs: Ugne Stolz, Tana Stadler, Timothy G. Vaughan
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.04.15.589468

The Fossilised Birth-Death Model is Identifiable

Auteurs: Kate Truman, Timothy G. Vaughan, Alex Gavryushkin, Alexandra Gavryushkina
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.02.08.579547

Bayesian phylodynamics of early vertebrate development in BEAST 2

Auteurs: Antoine Zwaans, Sophie Seidel, Marc Manceau, Tanja Stadler
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.07.04.601658

EpiFusion: Joint inference of the effective reproduction number by integrating phylodynamic and epidemiological modelling with particle filtering

Auteurs: Ciara Judge, Timothy G. Vaughan, Timothy Russel, Sam Abbott, Louis du Plessis, Tanja Stadler, Oliver Brady, Sarah Hill
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Sprint Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.12.18.572106

Thesis and dissertations (1)

Phylogenetic Methods in Single-Cell Biology

Auteurs: Sophie Seidel
Publié dans: NO JOURNAL TITLE, 2024
Éditeur: ETH Zürich
DOI: 10.3929/ethz-b-000674908