From Foundations of Phylodynamics to New Applications in Cell Biology

Informazioni relative al progetto

PhyCogy

ID dell’accordo di sovvenzione: 101001077

DOI

10.3030/101001077

Data della firma CE 20 Gennaio 2021

Data di avvio 1 Giugno 2021

Data di completamento 31 Maggio 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 999 540,00

Contributo UE

€ 1 999 540,00

Coordinato da

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Switzerland

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Data Management Plan DMP

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (3)

TiDeTree: a Bayesian phylogenetic framework to estimate single-cell trees and population dynamic parameters from genetic lineage tracing data

Autori: Sophie Seidel; Tanja Stadler
Pubblicato in: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Numero 1986, 2022, ISSN 0962-8452
Editore: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rspb.2022.1844

Robust Phylodynamic Analysis of Genetic Sequencing Data from Structured Populations

Autori: Jérémie Scire, Joëlle Barido-Sottani, Denise Kühnert, Timothy G. Vaughan, Tanja Stadler
Pubblicato in: Viruses, 2022, ISSN 1999-4915
Editore: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v14081648

HIV co-infection is associated with reduced Mycobacterium tuberculosis transmissibility in sub-Saharan Africa

Autori: Etthel M. Windels, Eddie M. Wampande, Moses L. Joloba, W. Henry Boom, Galo A. Goig, Helen Cox,Jerry Hella, Sonia Borrell, Sebastien Gagneux, Daniela Brites, Tanja Stadler
Pubblicato in: PLOS Pathogens, 2024, ISSN 1553-7374
Editore: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011675

Other (4)

Integrating Transmission Dynamics and Pathogen Evolution Through a Bayesian Approach

Autori: Ugne Stolz, Tana Stadler, Timothy G. Vaughan
Pubblicato in: bioRxiv, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.04.15.589468

The Fossilised Birth-Death Model is Identifiable

Autori: Kate Truman, Timothy G. Vaughan, Alex Gavryushkin, Alexandra Gavryushkina
Pubblicato in: bioRxiv, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.02.08.579547

Bayesian phylodynamics of early vertebrate development in BEAST 2

Autori: Antoine Zwaans, Sophie Seidel, Marc Manceau, Tanja Stadler
Pubblicato in: bioRxiv, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.07.04.601658

EpiFusion: Joint inference of the effective reproduction number by integrating phylodynamic and epidemiological modelling with particle filtering

Autori: Ciara Judge, Timothy G. Vaughan, Timothy Russel, Sam Abbott, Louis du Plessis, Tanja Stadler, Oliver Brady, Sarah Hill
Pubblicato in: bioRxiv, 2024
Editore: Cold Sprint Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.12.18.572106

Thesis and dissertations (1)

Phylogenetic Methods in Single-Cell Biology

Autori: Sophie Seidel
Pubblicato in: NO JOURNAL TITLE, 2024
Editore: ETH Zürich
DOI: 10.3929/ethz-b-000674908