From Foundations of Phylodynamics to New Applications in Cell Biology

Informacje na temat projektu

PhyCogy

Identyfikator umowy o grant: 101001077

DOI

10.3030/101001077

Data podpisania przez KE 20 Stycznia 2021

Data rozpoczęcia 1 Czerwca 2021

Data zakończenia 31 Maja 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 999 540,00

Wkład UE

€ 1 999 540,00

Koordynowany przez

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Switzerland

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Data Management Plan DMP

Publikacje

Peer reviewed articles (3)

TiDeTree: a Bayesian phylogenetic framework to estimate single-cell trees and population dynamic parameters from genetic lineage tracing data

Autorzy: Sophie Seidel; Tanja Stadler
Opublikowane w: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Numer 1986, 2022, ISSN 0962-8452
Wydawca: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rspb.2022.1844

Robust Phylodynamic Analysis of Genetic Sequencing Data from Structured Populations

Autorzy: Jérémie Scire, Joëlle Barido-Sottani, Denise Kühnert, Timothy G. Vaughan, Tanja Stadler
Opublikowane w: Viruses, 2022, ISSN 1999-4915
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v14081648

HIV co-infection is associated with reduced Mycobacterium tuberculosis transmissibility in sub-Saharan Africa

Autorzy: Etthel M. Windels, Eddie M. Wampande, Moses L. Joloba, W. Henry Boom, Galo A. Goig, Helen Cox,Jerry Hella, Sonia Borrell, Sebastien Gagneux, Daniela Brites, Tanja Stadler
Opublikowane w: PLOS Pathogens, 2024, ISSN 1553-7374
Wydawca: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011675

Other (4)

Integrating Transmission Dynamics and Pathogen Evolution Through a Bayesian Approach

Autorzy: Ugne Stolz, Tana Stadler, Timothy G. Vaughan
Opublikowane w: bioRxiv, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.04.15.589468

The Fossilised Birth-Death Model is Identifiable

Autorzy: Kate Truman, Timothy G. Vaughan, Alex Gavryushkin, Alexandra Gavryushkina
Opublikowane w: bioRxiv, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.02.08.579547

Bayesian phylodynamics of early vertebrate development in BEAST 2

Autorzy: Antoine Zwaans, Sophie Seidel, Marc Manceau, Tanja Stadler
Opublikowane w: bioRxiv, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.07.04.601658

EpiFusion: Joint inference of the effective reproduction number by integrating phylodynamic and epidemiological modelling with particle filtering

Autorzy: Ciara Judge, Timothy G. Vaughan, Timothy Russel, Sam Abbott, Louis du Plessis, Tanja Stadler, Oliver Brady, Sarah Hill
Opublikowane w: bioRxiv, 2024
Wydawca: Cold Sprint Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.12.18.572106

Thesis and dissertations (1)

Phylogenetic Methods in Single-Cell Biology

Autorzy: Sophie Seidel
Opublikowane w: NO JOURNAL TITLE, 2024
Wydawca: ETH Zürich
DOI: 10.3929/ethz-b-000674908