Regulatory and functional architecture of 'Nested-Sensitivity' microexon programs

Projektinformationen

NESTEDMICS

ID Finanzhilfevereinbarung: 101002275

DOI

10.3030/101002275

EK-Unterschriftsdatum 7 Mai 2021

Startdatum 1 Juli 2021

Enddatum 30 Juni 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 974 541,00

EU-Beitrag

€ 1 974 541,00

Koordiniert durch

UNIVERSIDAD POMPEU FABRA
Spain

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (8)

Parallel evolution of a splicing program controlling neuronal excitability in flies and mammals

Autoren: Torres-Méndez, A., Pop, S., Bonnal, S., Almudi, I., Roberts, R.J.V., Paolantoni, C., Alcaina, A., Avola, A., Martín-Anduaga, A., Haussmann, I.U., Morin, V., Casares, F., Soller, M., Kadener, S., Roignant, J.-Y., Prieto-Godino, L., Irimia, M.
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 8, 2022, Seite(n) eabk0445, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.abk0445

Unique transcriptomes of sensory and non-sensory neurons: insights from Splicing Regulatory States

Autoren: Ludovica Ciampi, Luis Serrano, Manuel Irimia
Veröffentlicht in: Molecular Systems Biology, Ausgabe 20, 2024, Seite(n) 296-310, ISSN 1744-4292
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s44320-024-00020-1

A highly conserved neuronal microexon in DAAM1 controls actin dynamics, RHOA/ROCK signaling, and memory formation

Autoren: Patryk Poliński, Marta Miret Cuesta, Alfonsa Zamora-Moratalla, Federica Mantica, Gerard Cantero-Recasens, Carlotta Viana, Miguel Sabariego-Navarro, Davide Normanno, Luis P. Iñiguez, Cruz Morenilla-Palao, Patricia Ordoño, Sophie Bonnal, Jonathan D. Ellis, Raúl Gómez-Riera, Hugo Fanlo-Ucar, Dominic S. Yap, María Martínez De Lagrán, Álvaro Fernández-Blanco, Cristina Rodríguez-Marin, Jon Pe
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-59430-w

<i>Insplico</i>: Effective computational tool for studying intron splicing order genome-wide with short and long RNA-seq reads

Autoren: Andre Gohr; Antonio Torres-Méndez; Sophie Bonnal; Manuel Irimia
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 51, 2023, Seite(n) e56, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2022.08.15.503947

Specialization of the photoreceptor transcriptome by Srrm3-dependent microexons is required for outer segment maintenance and vision.

Autoren: Ciampi, L., Mantica, F., Lopez-Blanch, L., Rodríguez-Marin, C., Cianferoni, D., Zang, J., Permanyer, J., Jiménez-Delgado, S., Bonnal, S., Miravet-Verde, S., Ruprecht, V., Neuhauss, S.C.F., Banfi, S., Carrella, S., Serrano, L., Head, S.A., Irimia, M.
Veröffentlicht in: Proc Natl Acad Sci U S A, Ausgabe 119(29), 2022, Seite(n) e2117090119, ISSN 1091-6490
Herausgeber: National Academy of Science
DOI: 10.1073/pnas.2117090119

Genetic regulation of RNA splicing in human pancreatic islets

Autoren: Goutham Atla; Silvia Bonàs-Guarch; Mirabai Cuenca-Ardura; Anthony Beucher; Daniel J. M. Crouch; Javier Garcia-Hurtado; Ignasi Moran; Miriam Cnop; Lena Eliasson; Jonathan Lou S. Esguerra; Décio L. Eizirik; Leif Groop; Thomas S. Jensen; Torben Hansen; Piero Marchetti; Josep M. Mercader; Hindrik Mulder; Chris R. Stabile-Barnett; Christian Thirion; David Torrents; Manuel Irimia; Rashmi B. Prasad; An
Veröffentlicht in: Genome Biology, 23(1). BMC, Ausgabe 2, 2022, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BMC
DOI: 10.1186/s13059-022-02757-0

Pancreatic microexons regulate islet function and glucose homeostasis

Autoren: Jonàs Juan-Mateu, Simon Bajew, Luis P. Íñiguez, Amaya Lopez-Pascual, Sophie Bonnal, Goutham Atla, Sílvia Bonàs-Guarch, Jorge Ferrer, Juan Valcárcel, Manuel Irimia
Veröffentlicht in: Nature Metabolism, Ausgabe 5, 2023, Seite(n) 219–236, ISSN 2522-5812
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42255-022-00734-2

Alternative splicing decouples local from global PRC2 activity

Autoren: Niccolò Arecco, Ivano Mocavini, Enrique Blanco, Cecilia Ballaré, Elina Libman, Sophie Bonnal, Manuel Irimia, Luciano Di Croce
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 84, 2025, Seite(n) 1049-1061.e8, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.02.011