Molecular choreography of bacterial chemotaxis signalling

Informations projet

ChemoTaxi

N° de convention de subvention: 101021133

DOI

10.3030/101021133

Date de signature de la CE 22 Juin 2021

Date de début 1 Septembre 2021

Date de fin 31 Août 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 781 133,00

Contribution de l’UE

€ 1 781 133,00

Coordonné par

DIAMOND LIGHT SOURCE LIMITED
United Kingdom

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (26)

Neutral sphingomyelinase 2 is required for HIV-1 maturation

Auteurs: Abdul A Waheed 1 , Yanan Zhu 2 , Eva Agostino 1 , Lwar Naing 1 , Yuta Hikichi 1 , Ferri Soheilian 3 , Seung-Wan Yoo 4 , Yun Song 5 , Peijun Zhang 2 5 6 , Barbara S Slusher 4 7 8 , Norman J Haughey 4 8 , Eric O Freed 1
Publié dans: PNAS, 2023, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2219475120

Structure of the native chemotaxis core signaling unit from phage E-protein lysed E. coli cells

Auteurs: "C Keith Cassidy # 1 2 , Zhuan Qin # 3 , Thomas Frosio 1 , Khoosheh Gosink 4 , Zhengyi Yang 1 , Mark S P Sansom 5 , Phillip J Stansfeld 6 , John S Parkinson 4 , Peijun Zhang"
Publié dans: mBio, 2023, ISSN 2150-7511
Éditeur: ASM
DOI: 10.1128/mbio.00793-23

A structural view of the SARS-CoV-2 virus and its assembly

Auteurs: Hardenbrook N and Zhang P
Publié dans: Current Opinion in Virology, 2022, ISSN 1879-6265
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coviro.2021.11.011

Cryogenic electron ptychographic single particle analysis with wide bandwidth information transfer

Auteurs: Xudong Pei; Liqi Zhou; Chen Huang; Mark Boyce; Judy S. Kim; Emanuela Liberti; Yiming Hu; Takeo Sasaki; Peter D. Nellist; Peijun Zhang; David I. Stuart; Angus I. Kirkland; Peng Wang
Publié dans: Nature Communications, Numéro 1, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38268-0

CryoEM structure of the super-constricted two-start dynamin 1 filament

Auteurs: Liu J, Alvarez FJD, Clare DK, Noel JK, Zhang P
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25741-x

ChAdOx1 COVID vaccines express RBD open prefusion SARS-CoV-2 spikes on the cell surface

Auteurs: Tao Ni,1,7,9 Luiza Mendonça,1,8,9 Yanan Zhu,1,9 Andrew Howe,2 Julika Radecke,2 Pranav M. Shah,1,3 Yuewen Sheng,2 Anna-Sophia Krebs,1 Helen M.E. Duyvesteyn,1 Elizabeth Allen,4 Teresa Lambe,4,5 Cameron Bisset,4 Alexandra Spencer,4 Susan Morris,6 David I. Stuart,1,2,3,6 Sarah Gilbert,4,5,6 and Peijun Zhang1,2,3,10,∗
Publié dans: iScience, 2023, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier Inc
DOI: 10.1016/j.isci.2023.107882

IceBreaker: Software for high-resolution single-particle cryo-EM with non-uniform ice

Auteurs: Olek M, Cowtan K, Webb D, Chaban Y, Zhang P
Publié dans: Structure, 2022, ISSN 0969-2126
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2022.01.005

The Effect of Inositol Hexakisphosphate on HIV-1 Particle Production and Infectivity can be Modulated by Mutations that Affect the Stability of the Immature Gag Lattice

Auteurs: Alex B Kleinpeter 1 , Yanan Zhu 2 , Donna L Mallery 3 , Sherimay D Ablan 4 , Long Chen 2 , Nathan Hardenbrook 2 , Adolfo Saiardi 5 , Leo C James 6 , Peijun Zhang 7 , Eric O Freed 8
Publié dans: Journal of Molecular Biology, 2023, ISSN 0022-2836
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168037

Mechanisms of E. coli chemotaxis signaling pathways visualized using cryoET and computational approaches

Auteurs: Hadjidemetriou K, Kaur S, Cassidy CK, Zhang P
Publié dans: Biochem Soc Trans, 2022, ISSN 1470-8752
Éditeur: Biochemical Society
DOI: 10.1042/bst20220191

The molecular basis of regulation of bacterial capsule assembly by Wzc

Auteurs: Yang Y, Liu J, Clarke BR, Seidel L, Bolla JR, Ward PN, Zhang P, Robinson CV, Whitfield C, Naismith JH
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24652-1

Structure of native chromatin fibres revealed by Cryo-ET in situ

Auteurs: Zhen Hou, Frank Nightingale, Yanan Zhu, Craig MacGregor-Chatwin & Peijun Zhang
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-42072-1

Probing the biogenesis pathway and dynamics of thylakoid membranes

Auteurs: Huokko T, Ni T, Dykes GF, Simpson DM, Brownridge P, Conradi FD, Beynon RJ, Nixon PJ, Mullineaux CW, Zhang P, Liu LN
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23680-1

Studying bacterial chemosensory array with CryoEM

Auteurs: Qin Z, Zhang P
Publié dans: Biochem Soc Trans, 2021, ISSN 1470-8752
Éditeur: Portland Press
DOI: 10.1042/bst20210080

Structure and assembly of cargo Rubisco in two native α-carboxysomes

Auteurs: Ni T, Sun Y, Burn W, Al-Hazeem MMJ, Zhu Y, Yu X, Liu LN, Zhang P
Publié dans: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32004-w

Cryo-electron tomography to study viral infection

Auteurs: Miles Graham and Peijun Zhang
Publié dans: Biochem Soc Trans, 2023, ISSN 0300-5127
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20230103

Cryo-electron Tomography Remote Data Collection and Subtomogram Averaging

Auteurs: Sheng Y, Morris K, Radecke J, Zhang P
Publié dans: JoVE, 2022, ISSN 1940-087X
Éditeur: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/63923

Correlative multi-scale cryo-imaging unveils SARS-CoV-2 assembly and egress

Auteurs: Mendonça L, Howe A, Gilchrist JB, Sheng Y, Sun D, Knight ML, Zanetti-Domingues LC, Bateman B, Krebs AS, Chen L, Radecke J, Li VD, Ni T, Kounatidis I, Koronfel MA, Szynkiewicz M, Harkiolaki M, Martin-Fernandez ML, James W, Zhang P
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24887-y

Structure and activity of particulate methane monooxygenase arrays in methanotrophs

Auteurs: Zhu Y, Koo CW, Cassidy CK, Spink MC, Ni T, Zanetti-Domingues LC, Bateman B, Martin-Fernandez ML, Shen J, Sheng Y, Song Y, Yang Z, Rosenzweig AC, Zhang P
Publié dans: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32752-9

Structure of native HIV-1 cores and their interactions with IP6 and CypA

Auteurs: Tao Ni 1 , Yanan Zhu 1 , Zhengyi Yang 2 , Chaoyi Xu 3 , Yuriy Chaban 2 , Tanya Nesterova 3 , Jiying Ning 4 , Till Böcking 5 , Michael W Parker 6 7 , Christina Monnie 4 , Jinwoo Ahn 4 , Juan R Perilla 3 , Peijun Zhang 1 2 8
Publié dans: Science advances, 2021, ISSN 2375-2548
Éditeur: Science
DOI: 10.1126/sciadv.abj5715

Structural Analysis of Retrovirus Assembly and Maturation

Auteurs: Anna-Sophia Krebs,1,† Luiza M. Mendonça,1,† and Peijun Zhang1,2,3,*
Publié dans: Viruses, 2022, ISSN 1999-4915
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v14010054

Multidisciplinary studies with mutated HIV-1 capsid proteins reveal structural mechanisms of lattice stabilization

Auteurs: Anna T. Gres,1,2 Karen A. Kirby,3,4 William M. McFadden,3 Haijuan Du,3 Dandan Liu,1,5 Chaoyi Xu,6 Alexander J. Bryer,6 Juan R. Perilla,6,7 Jiong Shi,8 Christopher Aiken,8 Xiaofeng Fu,9 Peijun Zhang,9,10,11 Ashwanth C. Francis,12,13 Gregory B. Melikyan,4,13 and Stefan G. Sarafianos
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41197-7

Molecular architecture and conservation of an immature human endogenous retrovirus

Auteurs: "Anna-Sophia Krebs # 1 , Hsuan-Fu Liu # 2 , Ye Zhou # 3 , Juan S Rey 4 , Lev Levintov 4 , Juan Shen 1 , Andrew Howe 5 , Juan R Perilla 6 , Alberto Bartesaghi 7 8 9 , Peijun Zhang 10 11 12"
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-40786-w

Intrinsically disordered CsoS2 acts as a general molecular thread for α-carboxysome shell assembly

Auteurs: "Tao Ni,corresponding author#1,2 Qiuyao Jiang,#3 Pei Cing Ng,3 Juan Shen,1 Hao Dou,1 Yanan Zhu,1 Julika Radecke,4 Gregory F. Dykes,3 Fang Huang,3 Lu-Ning Liu,corresponding author3,5 and Peijun Zhangcorresponding author1,4,6"
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41211-y

High-resolution in situ structure determination by cryo-electron tomography and subtomogram averaging using emClarity

Auteurs: Ni T, Frosio T, Mendonça L, Sheng Y, Clare D, Himes BA, Zhang P
Publié dans: Nature Protocols, 2022, ISSN 1750-2799
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41596-021-00648-5

Recent structural advances in bacterial chemotaxis signalling

Auteurs: Riechmann C, Zhang P
Publié dans: Curr Opin Struct Biol ., 2023, ISSN 1879-033X
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102565

Cryo-EM structures of perforin-2 in isolation and assembled on a membrane suggest a mechanism for pore formation

Auteurs: Yu X, Ni T, Munson G, Zhang P, Gilbert RJC
Publié dans: The EMBO Journal, 2022, ISSN 1460-2075
Éditeur: EMBO press
DOI: 10.15252/embj.2022111857

Conference proceedings (1)

Application of super-resolution and correlative double sampling in cryo-electron microscopy

Auteurs: Sheng Y, Harrison PJ, Vogirala V, Yang Z, Strain-Damerell C, Frosio T, Himes BA, Siebert CA, Zhang P, Clare DK
Publié dans: Faraday Discussions, 2022
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2fd00049k