Molecular choreography of bacterial chemotaxis signalling

Informacje na temat projektu

ChemoTaxi

Identyfikator umowy o grant: 101021133

DOI

10.3030/101021133

Data podpisania przez KE 22 Czerwca 2021

Data rozpoczęcia 1 Września 2021

Data zakończenia 31 Sierpnia 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 781 133,00

Wkład UE

€ 1 781 133,00

Koordynowany przez

DIAMOND LIGHT SOURCE LIMITED
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (26)

Neutral sphingomyelinase 2 is required for HIV-1 maturation

Autorzy: Abdul A Waheed 1 , Yanan Zhu 2 , Eva Agostino 1 , Lwar Naing 1 , Yuta Hikichi 1 , Ferri Soheilian 3 , Seung-Wan Yoo 4 , Yun Song 5 , Peijun Zhang 2 5 6 , Barbara S Slusher 4 7 8 , Norman J Haughey 4 8 , Eric O Freed 1
Opublikowane w: PNAS, 2023, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2219475120

Structure of the native chemotaxis core signaling unit from phage E-protein lysed E. coli cells

Autorzy: "C Keith Cassidy # 1 2 , Zhuan Qin # 3 , Thomas Frosio 1 , Khoosheh Gosink 4 , Zhengyi Yang 1 , Mark S P Sansom 5 , Phillip J Stansfeld 6 , John S Parkinson 4 , Peijun Zhang"
Opublikowane w: mBio, 2023, ISSN 2150-7511
Wydawca: ASM
DOI: 10.1128/mbio.00793-23

A structural view of the SARS-CoV-2 virus and its assembly

Autorzy: Hardenbrook N and Zhang P
Opublikowane w: Current Opinion in Virology, 2022, ISSN 1879-6265
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coviro.2021.11.011

Cryogenic electron ptychographic single particle analysis with wide bandwidth information transfer

Autorzy: Xudong Pei; Liqi Zhou; Chen Huang; Mark Boyce; Judy S. Kim; Emanuela Liberti; Yiming Hu; Takeo Sasaki; Peter D. Nellist; Peijun Zhang; David I. Stuart; Angus I. Kirkland; Peng Wang
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 1, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38268-0

CryoEM structure of the super-constricted two-start dynamin 1 filament

Autorzy: Liu J, Alvarez FJD, Clare DK, Noel JK, Zhang P
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25741-x

ChAdOx1 COVID vaccines express RBD open prefusion SARS-CoV-2 spikes on the cell surface

Autorzy: Tao Ni,1,7,9 Luiza Mendonça,1,8,9 Yanan Zhu,1,9 Andrew Howe,2 Julika Radecke,2 Pranav M. Shah,1,3 Yuewen Sheng,2 Anna-Sophia Krebs,1 Helen M.E. Duyvesteyn,1 Elizabeth Allen,4 Teresa Lambe,4,5 Cameron Bisset,4 Alexandra Spencer,4 Susan Morris,6 David I. Stuart,1,2,3,6 Sarah Gilbert,4,5,6 and Peijun Zhang1,2,3,10,∗
Opublikowane w: iScience, 2023, ISSN 2589-0042
Wydawca: Elsevier Inc
DOI: 10.1016/j.isci.2023.107882

IceBreaker: Software for high-resolution single-particle cryo-EM with non-uniform ice

Autorzy: Olek M, Cowtan K, Webb D, Chaban Y, Zhang P
Opublikowane w: Structure, 2022, ISSN 0969-2126
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2022.01.005

The Effect of Inositol Hexakisphosphate on HIV-1 Particle Production and Infectivity can be Modulated by Mutations that Affect the Stability of the Immature Gag Lattice

Autorzy: Alex B Kleinpeter 1 , Yanan Zhu 2 , Donna L Mallery 3 , Sherimay D Ablan 4 , Long Chen 2 , Nathan Hardenbrook 2 , Adolfo Saiardi 5 , Leo C James 6 , Peijun Zhang 7 , Eric O Freed 8
Opublikowane w: Journal of Molecular Biology, 2023, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168037

Mechanisms of E. coli chemotaxis signaling pathways visualized using cryoET and computational approaches

Autorzy: Hadjidemetriou K, Kaur S, Cassidy CK, Zhang P
Opublikowane w: Biochem Soc Trans, 2022, ISSN 1470-8752
Wydawca: Biochemical Society
DOI: 10.1042/bst20220191

The molecular basis of regulation of bacterial capsule assembly by Wzc

Autorzy: Yang Y, Liu J, Clarke BR, Seidel L, Bolla JR, Ward PN, Zhang P, Robinson CV, Whitfield C, Naismith JH
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24652-1

Structure of native chromatin fibres revealed by Cryo-ET in situ

Autorzy: Zhen Hou, Frank Nightingale, Yanan Zhu, Craig MacGregor-Chatwin & Peijun Zhang
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-42072-1

Probing the biogenesis pathway and dynamics of thylakoid membranes

Autorzy: Huokko T, Ni T, Dykes GF, Simpson DM, Brownridge P, Conradi FD, Beynon RJ, Nixon PJ, Mullineaux CW, Zhang P, Liu LN
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23680-1

Studying bacterial chemosensory array with CryoEM

Autorzy: Qin Z, Zhang P
Opublikowane w: Biochem Soc Trans, 2021, ISSN 1470-8752
Wydawca: Portland Press
DOI: 10.1042/bst20210080

Structure and assembly of cargo Rubisco in two native α-carboxysomes

Autorzy: Ni T, Sun Y, Burn W, Al-Hazeem MMJ, Zhu Y, Yu X, Liu LN, Zhang P
Opublikowane w: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32004-w

Cryo-electron tomography to study viral infection

Autorzy: Miles Graham and Peijun Zhang
Opublikowane w: Biochem Soc Trans, 2023, ISSN 0300-5127
Wydawca: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20230103

Cryo-electron Tomography Remote Data Collection and Subtomogram Averaging

Autorzy: Sheng Y, Morris K, Radecke J, Zhang P
Opublikowane w: JoVE, 2022, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/63923

Correlative multi-scale cryo-imaging unveils SARS-CoV-2 assembly and egress

Autorzy: Mendonça L, Howe A, Gilchrist JB, Sheng Y, Sun D, Knight ML, Zanetti-Domingues LC, Bateman B, Krebs AS, Chen L, Radecke J, Li VD, Ni T, Kounatidis I, Koronfel MA, Szynkiewicz M, Harkiolaki M, Martin-Fernandez ML, James W, Zhang P
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24887-y

Structure and activity of particulate methane monooxygenase arrays in methanotrophs

Autorzy: Zhu Y, Koo CW, Cassidy CK, Spink MC, Ni T, Zanetti-Domingues LC, Bateman B, Martin-Fernandez ML, Shen J, Sheng Y, Song Y, Yang Z, Rosenzweig AC, Zhang P
Opublikowane w: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32752-9

Structure of native HIV-1 cores and their interactions with IP6 and CypA

Autorzy: Tao Ni 1 , Yanan Zhu 1 , Zhengyi Yang 2 , Chaoyi Xu 3 , Yuriy Chaban 2 , Tanya Nesterova 3 , Jiying Ning 4 , Till Böcking 5 , Michael W Parker 6 7 , Christina Monnie 4 , Jinwoo Ahn 4 , Juan R Perilla 3 , Peijun Zhang 1 2 8
Opublikowane w: Science advances, 2021, ISSN 2375-2548
Wydawca: Science
DOI: 10.1126/sciadv.abj5715

Structural Analysis of Retrovirus Assembly and Maturation

Autorzy: Anna-Sophia Krebs,1,† Luiza M. Mendonça,1,† and Peijun Zhang1,2,3,*
Opublikowane w: Viruses, 2022, ISSN 1999-4915
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v14010054

Multidisciplinary studies with mutated HIV-1 capsid proteins reveal structural mechanisms of lattice stabilization

Autorzy: Anna T. Gres,1,2 Karen A. Kirby,3,4 William M. McFadden,3 Haijuan Du,3 Dandan Liu,1,5 Chaoyi Xu,6 Alexander J. Bryer,6 Juan R. Perilla,6,7 Jiong Shi,8 Christopher Aiken,8 Xiaofeng Fu,9 Peijun Zhang,9,10,11 Ashwanth C. Francis,12,13 Gregory B. Melikyan,4,13 and Stefan G. Sarafianos
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41197-7

Molecular architecture and conservation of an immature human endogenous retrovirus

Autorzy: "Anna-Sophia Krebs # 1 , Hsuan-Fu Liu # 2 , Ye Zhou # 3 , Juan S Rey 4 , Lev Levintov 4 , Juan Shen 1 , Andrew Howe 5 , Juan R Perilla 6 , Alberto Bartesaghi 7 8 9 , Peijun Zhang 10 11 12"
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-40786-w

Intrinsically disordered CsoS2 acts as a general molecular thread for α-carboxysome shell assembly

Autorzy: "Tao Ni,corresponding author#1,2 Qiuyao Jiang,#3 Pei Cing Ng,3 Juan Shen,1 Hao Dou,1 Yanan Zhu,1 Julika Radecke,4 Gregory F. Dykes,3 Fang Huang,3 Lu-Ning Liu,corresponding author3,5 and Peijun Zhangcorresponding author1,4,6"
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41211-y

High-resolution in situ structure determination by cryo-electron tomography and subtomogram averaging using emClarity

Autorzy: Ni T, Frosio T, Mendonça L, Sheng Y, Clare D, Himes BA, Zhang P
Opublikowane w: Nature Protocols, 2022, ISSN 1750-2799
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41596-021-00648-5

Recent structural advances in bacterial chemotaxis signalling

Autorzy: Riechmann C, Zhang P
Opublikowane w: Curr Opin Struct Biol ., 2023, ISSN 1879-033X
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102565

Cryo-EM structures of perforin-2 in isolation and assembled on a membrane suggest a mechanism for pore formation

Autorzy: Yu X, Ni T, Munson G, Zhang P, Gilbert RJC
Opublikowane w: The EMBO Journal, 2022, ISSN 1460-2075
Wydawca: EMBO press
DOI: 10.15252/embj.2022111857

Conference proceedings (1)

Application of super-resolution and correlative double sampling in cryo-electron microscopy

Autorzy: Sheng Y, Harrison PJ, Vogirala V, Yang Z, Strain-Damerell C, Frosio T, Himes BA, Siebert CA, Zhang P, Clare DK
Opublikowane w: Faraday Discussions, 2022
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2fd00049k