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Global mapping of second messenger c-di-GMP signaling networks in bacteria using proteomics

Projektbeschreibung

Kartierung der adaptiven Signalgebung in krankheitserregenden Bakterien

Bakterien sind von Natur aus in der Lage, schnell auf äußere Signale zu reagieren und sich an Veränderungen in ihrer unmittelbaren Umgebung anzupassen. An der Anpassung des Zellverhaltens sind Signale beteiligt, die innerhalb der Zelle über bestimmte Signalwege übertragen werden. Die Forschenden des EU-finanzierten Projektes SNiB-cdG-P konzentrieren sich in ihrer Arbeit auf zyklisches di-GMP-Guanosinmonophosphat (c-di-GMP), ein entscheidendes Signalmolekül für das Wachstum und Überleben von Bakterien. Mithilfe modernster Proteomik und massenspektrometrischer Verfahren werden sie das c-di-GMP-Signalnetzwerk in gramnegativen Bakterien kartieren. Die Ergebnisse werden ein besseres Verständnis von der Relevanz von c-di-GMP für die Antibiotikaresistenz und die bakterielle Pathogenese ermöglichen.

Ziel

To survive in diverse niches, bacteria must adapt to changes in their local environment by sensing and responding to environmental cues. External cues are transduced through complex signaling networks throughout a cell and drive diverse changes in cellular behavior. In bacteria, cyclic di-guanosine-monophosphate (c-di-GMP) is a nucleotide-derived second messenger that mediates signal transduction of important biological processes for bacterial growth and survival e.g. motility, biofilm formation and metabolism. These biological processes are also crucial in clinical settings as they underlay antibiotic resistance in important pathogenic bacteria. Recent advances in MS-based proteomics have provided different tools to investigate the proteome of an organism in a systematic and global manner. Especially, thermal proteome profiling (TPP) and limited-proteolysis MS (LiP-MS) are pioneering methods to study change of protein states proteome-wide. I aim to employ these proteomics based approaches to achieve the global map of the c-di-GMP signaling network in two different bacteria, Escherichia coli and Caulobacter crescentus, both are model organisms of Gram-negative bacteria. Furthermore, I will apply these methods to investigate signaling network of another important second messenger, (p)ppGpp, and explore how the networks of these two messenger molecules interact in bacteria to dictate cellular physiology.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2020

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Koordinator

UNIVERSITAT BASEL
Netto-EU-Beitrag
€ 191 149,44
Adresse
PETERSPLATZ 1
4051 Basel
Schweiz
Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
€ 191 149,44