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Understanding molecular principles of regulated mRNA degradation on translating ribosomes

Descrizione del progetto

Regolazione attiva dell’mRNA durante la traduzione

Nelle cellule eucariotiche, la regolazione dell’espressione genica avviene a livello genomico, nonché durante o dopo la trascrizione e la traduzione. L’elaborazione, l’esportazione e la stabilità dell’mRNA costituiscono parametri importanti in questo complesso processo. Gli scienziati del progetto mRNA-DEG-RIBOSOME, finanziato dall’UE, stanno studiando la regolazione attiva dell’mRNA mentre viene tradotto dal ribosoma. In particolare, stanno studiando il ruolo dei polipeptidi emergenti e come questi attraggono fattori di riconoscimento specifici che potrebbero degradare l’mRNA mentre viene tradotto. Il lavoro fornirà informazioni meccanicistiche sul circuito di retroazione dell’mRNA della tubulina, che è fondamentale per la mitosi e la fedele segregazione dei cromosomi.

Obiettivo

Cell tightly regulate mRNA processing, localisation and stability to ensure accurate gene expression in diverse cellular states and conditions. Most of these mRNA regulation steps have traditionally been thought to primarily happen before translation. However, recent discoveries highlight the role of nascent polypeptides on translating ribosomes in the active regulation of mRNAs. As the nascent protein emerges from the ribosome, it marks the identity of the encoding mRNA by its unique amino acid sequence. This allows cotranslational engagement by specific polypeptide recognition factors on the ribosome, providing them access to the associated mRNA. A striking example for such regulation is the negative feedback loop in the expression of tubulins known as “tubulin autoregulation”. In this case, tubulin mRNA is degraded cotranslationally when cells sense excess free tubulin, which is critical during mitosis to ensure faithful chromosome segregation. Recently, the first specific factor in this pathway has been identified: TTC5 recognises the N-terminus of nascent tubulin emerging from the translating ribosome and triggers degradation of the associated mRNA. However, the events leading to tubulin mRNA decay downstream of TTC5 remain elusive.

In mRNA-DEG-RIBOSOME I will use tubulin autoregulation as a model system to study how the nascent chain on translating ribosomes directs mRNA degradation. Specifically, I aim to: (1) identify factors acting downstream of TTC5 required for tubulin mRNA degradation using cutting-edge mass spectrometry and genetic screening methods; (2) understand the mechanistic role of each factor in TTC5-directed mRNA degradation by using a powerful in vitro reconstitution approach; and (3) expand the understanding of nascent chain-dependent mRNA degradation by investigating related feedback systems. Thus, my work will to provide a conceptual framework for how cells have evolved to exploit nascent polypeptide recognition to direct mRNA fate.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNITED KINGDOM RESEARCH AND INNOVATION
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 212 933,76
Indirizzo
POLARIS HOUSE NORTH STAR AVENUE
SN2 1FL SWINDON
Regno Unito

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Regione
South West (England) Gloucestershire, Wiltshire and Bristol/Bath area Swindon
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 212 933,76
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