Decoding animal genomes into cell types

Información del proyecto

Genome2Cells

Identificador del acuerdo de subvención: 101054387

DOI

10.3030/101054387

Fecha de la firma de la CE 23 Noviembre 2022

Fecha de inicio 1 Junio 2023

Fecha de finalización 31 Mayo 2028

Financiado con arreglo a

• European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 500 000,00

Aportación de la UE

€ 2 500 000,00

Coordinado por

VIB VZW
Belgium

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Resultado final

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of data management plan

Publicaciones

Peer reviewed articles (6)

Nova-ST: Nano-patterned ultra-dense platform for spatial transcriptomics

Autores: Suresh Poovathingal; Kristofer Davie; Lars E. Borm; Roel Vandepoel; Nicolas Poulvellarie; Annelien Verfaillie; Nikky Corthout; Stein Aerts
Publicado en: Cell Reports Methods, 2024, ISSN 2667-2375
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/J.CRMETH.2024.100831

eLife

Autores: Jasper Janssens; Pierre Mangeol; Nikolai Hecker; Gabriele Partel; Katina I Spanier; Joy N Ismail; Gert J Hulselmans; Stein Aerts; Frank Schnorrer
Publicado en: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Editor: eLife
DOI: 10.7554/ELIFE.92618

Nature

Autores: Ibrahim I. Taskiran; Katina I. Spanier; Hannah Dickmänken; Niklas Kempynck; Alexandra Pančíková; Eren Can Ekşi; Gert Hulselmans; Joy N. Ismail; Koen Theunis; Roel Vandepoel; Valerie Christiaens; David Mauduit; Stein Aerts
Publicado en: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2022.07.26.501466V1

Evaluating methods for the prediction of cell-type-specific enhancers in the mammalian cortex

Autores: Nelson J. Johansen; Niklas Kempynck; Nathan R. Zemke; Saroja Somasundaram; Seppe De Winter; Marcus Hooper; Deepanjali Dwivedi; Ruchi Lohia; Fabien Wehbe; Bocheng Li; Darina Abaffyová; Ethan J. Armand; Julie De Man; Eren Can Eksi; Nikolai Hecker; Gert Hulselmans; Vasilis Konstantakos; David Mauduit; John K. Mich; Gabriele Partel; Tanya L. Daigle; Boaz P. Levi; Kai Zhang; Yoshiaki Tanaka; Jesse Gillis; Jonathan T. Ting; Yoav Ben-Simon; Jeremy Miller; Joseph R. Ecker; Bing Ren; Stein Aerts; Ed S. Lein; Bosiljka Tasic; Trygve E. Bakken
Publicado en: Cell Genomics, 2024, ISSN 2666-979X
Editor: Elsevier
DOI: 10.1101/2024.08.21.609075

Modelling and design of transcriptional enhancers

Autores: Seppe De Winter; Vasileios Konstantakos; Stein Aerts
Publicado en: Nature Reviews Bioengineering, 2025, ISSN 2731-6092
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1038/S44222-025-00280-Y

Enhancer-driven cell type comparison reveals similarities between the mammalian and bird pallium

Autores: Nikolai Hecker, Niklas Kempynck, David Mauduit, Darina Abaffyová, Roel Vandepoel, Sam Dieltiens, Lars Borm, Ioannis Sarropoulos, Carmen Bravo González-Blas, Julie De Man, Kristofer Davie, Elke Leysen, Jeroen Vandensteen, Rani Moors, Gert Hulselmans, Lynette Lim, Joris De Wit, Valerie Christiaens, Suresh Poovathingal, Stein Aerts
Publicado en: Science, Edición 387, 2025, ISSN 0036-8075
Editor: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCIENCE.ADP3957