Decoding animal genomes into cell types

Informations projet

Genome2Cells

N° de convention de subvention: 101054387

DOI

10.3030/101054387

Date de signature de la CE 23 Novembre 2022

Date de début 1 Juin 2023

Date de fin 31 Mai 2028

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 500 000,00

Coordonné par

VIB VZW
Belgium

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of data management plan

Publications

Peer reviewed articles (6)

Nova-ST: Nano-patterned ultra-dense platform for spatial transcriptomics

Auteurs: Suresh Poovathingal; Kristofer Davie; Lars E. Borm; Roel Vandepoel; Nicolas Poulvellarie; Annelien Verfaillie; Nikky Corthout; Stein Aerts
Publié dans: Cell Reports Methods, 2024, ISSN 2667-2375
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/J.CRMETH.2024.100831

eLife

Auteurs: Jasper Janssens; Pierre Mangeol; Nikolai Hecker; Gabriele Partel; Katina I Spanier; Joy N Ismail; Gert J Hulselmans; Stein Aerts; Frank Schnorrer
Publié dans: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife
DOI: 10.7554/ELIFE.92618

Nature

Auteurs: Ibrahim I. Taskiran; Katina I. Spanier; Hannah Dickmänken; Niklas Kempynck; Alexandra Pančíková; Eren Can Ekşi; Gert Hulselmans; Joy N. Ismail; Koen Theunis; Roel Vandepoel; Valerie Christiaens; David Mauduit; Stein Aerts
Publié dans: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2022.07.26.501466V1

Evaluating methods for the prediction of cell-type-specific enhancers in the mammalian cortex

Auteurs: Nelson J. Johansen; Niklas Kempynck; Nathan R. Zemke; Saroja Somasundaram; Seppe De Winter; Marcus Hooper; Deepanjali Dwivedi; Ruchi Lohia; Fabien Wehbe; Bocheng Li; Darina Abaffyová; Ethan J. Armand; Julie De Man; Eren Can Eksi; Nikolai Hecker; Gert Hulselmans; Vasilis Konstantakos; David Mauduit; John K. Mich; Gabriele Partel; Tanya L. Daigle; Boaz P. Levi; Kai Zhang; Yoshiaki Tanaka; Jesse Gillis; Jonathan T. Ting; Yoav Ben-Simon; Jeremy Miller; Joseph R. Ecker; Bing Ren; Stein Aerts; Ed S. Lein; Bosiljka Tasic; Trygve E. Bakken
Publié dans: Cell Genomics, 2024, ISSN 2666-979X
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1101/2024.08.21.609075

Modelling and design of transcriptional enhancers

Auteurs: Seppe De Winter; Vasileios Konstantakos; Stein Aerts
Publié dans: Nature Reviews Bioengineering, 2025, ISSN 2731-6092
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/S44222-025-00280-Y

Enhancer-driven cell type comparison reveals similarities between the mammalian and bird pallium

Auteurs: Nikolai Hecker, Niklas Kempynck, David Mauduit, Darina Abaffyová, Roel Vandepoel, Sam Dieltiens, Lars Borm, Ioannis Sarropoulos, Carmen Bravo González-Blas, Julie De Man, Kristofer Davie, Elke Leysen, Jeroen Vandensteen, Rani Moors, Gert Hulselmans, Lynette Lim, Joris De Wit, Valerie Christiaens, Suresh Poovathingal, Stein Aerts
Publié dans: Science, Numéro 387, 2025, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCIENCE.ADP3957