Decoding animal genomes into cell types

Informacje na temat projektu

Genome2Cells

Identyfikator umowy o grant: 101054387

DOI

10.3030/101054387

Data podpisania przez KE 23 Listopada 2022

Data rozpoczęcia 1 Czerwca 2023

Data zakończenia 31 Maja 2028

Finansowanie w ramach

• European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 500 000,00

Wkład UE

€ 2 500 000,00

Koordynowany przez

VIB VZW
Belgium

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of data management plan

Publikacje

Peer reviewed articles (7)

Nova-ST: Nano-patterned ultra-dense platform for spatial transcriptomics

Autorzy: Suresh Poovathingal; Kristofer Davie; Lars E. Borm; Roel Vandepoel; Nicolas Poulvellarie; Annelien Verfaillie; Nikky Corthout; Stein Aerts
Opublikowane w: Cell Reports Methods, 2024, ISSN 2667-2375
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/J.CRMETH.2024.100831

eLife

Autorzy: Jasper Janssens; Pierre Mangeol; Nikolai Hecker; Gabriele Partel; Katina I Spanier; Joy N Ismail; Gert J Hulselmans; Stein Aerts; Frank Schnorrer
Opublikowane w: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife
DOI: 10.7554/ELIFE.92618

Nature

Autorzy: Ibrahim I. Taskiran; Katina I. Spanier; Hannah Dickmänken; Niklas Kempynck; Alexandra Pančíková; Eren Can Ekşi; Gert Hulselmans; Joy N. Ismail; Koen Theunis; Roel Vandepoel; Valerie Christiaens; David Mauduit; Stein Aerts
Opublikowane w: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2022.07.26.501466V1

Evaluating methods for the prediction of cell-type-specific enhancers in the mammalian cortex

Autorzy: Nelson J. Johansen; Niklas Kempynck; Nathan R. Zemke; Saroja Somasundaram; Seppe De Winter; Marcus Hooper; Deepanjali Dwivedi; Ruchi Lohia; Fabien Wehbe; Bocheng Li; Darina Abaffyová; Ethan J. Armand; Julie De Man; Eren Can Eksi; Nikolai Hecker; Gert Hulselmans; Vasilis Konstantakos; David Mauduit; John K. Mich; Gabriele Partel; Tanya L. Daigle; Boaz P. Levi; Kai Zhang; Yoshiaki Tanaka; Jesse Gillis; Jonathan T. Ting; Yoav Ben-Simon; Jeremy Miller; Joseph R. Ecker; Bing Ren; Stein Aerts; Ed S. Lein; Bosiljka Tasic; Trygve E. Bakken
Opublikowane w: Cell Genomics, 2024, ISSN 2666-979X
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1101/2024.08.21.609075

Modelling and design of transcriptional enhancers

Autorzy: Seppe De Winter; Vasileios Konstantakos; Stein Aerts
Opublikowane w: Nature Reviews Bioengineering, 2025, ISSN 2731-6092
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/S44222-025-00280-Y

Enhancer-driven cell type comparison reveals similarities between the mammalian and bird pallium

Autorzy: Nikolai Hecker, Niklas Kempynck, David Mauduit, Darina Abaffyová, Roel Vandepoel, Sam Dieltiens, Lars Borm, Ioannis Sarropoulos, Carmen Bravo González-Blas, Julie De Man, Kristofer Davie, Elke Leysen, Jeroen Vandensteen, Rani Moors, Gert Hulselmans, Lynette Lim, Joris De Wit, Valerie Christiaens, Suresh Poovathingal, Stein Aerts
Opublikowane w: Science, Numer 387, 2025, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCIENCE.ADP3957

Evaluating single-cell ATAC-seq atlasing technologies using sequence-to-function modeling

Autorzy: Hannah Dickmänken, Marta Wojno, Lukas Mahieu, Koen Theunis, Eren Can Ekşi, Valerie Christiaens, Niklas Kempynck, Florian V. De Rop, Natalie Roels, Katina I. Spanier, Roel Vandepoel, Gert Hulselmans, Suresh Poovathingal, Stein Aerts
Opublikowane w: Nature Communications, 2026, ISSN 2041-1723
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-026-68742-4