Descripción del proyecto
Diagnósticos rápido de enfermedades bacterianas para la acuicultura
Los brotes de enfermedades bacterianas constituyen un reto constante para la piscicultura, ya que acarrean importantes pérdidas económicas. En la naturaleza, los microorganismos viven en comunidades diversas. Por lo tanto, una combinación de especies puede provocar infecciones. Sin embargo, la participación de especies similares en la progresión de una enfermedad es poco conocida y representa un importante reto diagnóstico. El proyecto chelOMICS, financiado por las Acciones Marie Skłodowska-Curie, es una ambiciosa iniciativa multidisciplinaria destinada a comprender las interacciones patógeno-hospedador en peces de acuicultura para tres enfermedades bacterianas importantes, a saber: la vibriosis, la fotobacteriosis y la furunculosis. Su equipo empleará modernas herramientas multiómicas, así como técnicas metabolómicas y metagenómicas, para estudiar el metaboloma de los sideróforos, que son factores clave de virulencia durante la infección, y emplearlos como biomarcadores para el diagnóstico temprano de enfermedades.
Objetivo
Outbreaks of bacterial diseases pose a persistent challenge to fish farming around the world causing significant economic loss. To improve efficiency, safety, and sustainability of aquaculture new health monitoring and rapid disease diagnostics approaches are required. Here, we propose an ambitious multidisciplinary project that implements modern multi-omics tools, in particular metabolomics and metagenomics, to provide a holistic understanding of host-pathogen interactions in farmed fish in the context of three major bacterial diseases; vibriosis, photobacteriosis, and furunculosis. This project will focus specifically on the metabolome of siderophores, iron chelating microbial metabolites that are key virulence factors during infection, and their use as biomarkers for early disease diagnostics. In nature, microorganisms exist in diverse communities and therefore infections can be caused by a combination of species yet the involvement of co-species in disease progression is poorly understood and represents a great diagnostic challenge. I have gained extensive skills in metabolomics through my PhD in Australia and postdoctoral experience in Germany. This project will enable me to go one step further; I will use different bioinformatic tools as well as imaging analytical chemistry (MALDI-IMS) approaches to integrate metabolomics and microbiome data and answer important ecological questions in aquaculture. I am highly motivated to take on this new challenge and acquire new scientific and transferable skills, which will strengthen my profile as an independent researcher and increase my opportunities for a permanent position after the fellowship.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Programa(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinador
15001 La Coruna
España