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chelOMICS: Application of multi-OMICS approaches to provide a holistic understanding of siderophore mediated host-pathogen interactions and new diagnostic options for aquaculture fish infections

Description du projet

Diagnostic rapide des maladies bactériennes dans le domaine de l’aquaculture

Les épidémies de maladies bactériennes représentent un défi de tous les instants pour la pisciculture et entraînent des pertes économiques considérables. Dans la nature, les micro-organismes forment des communautés diversifiées. Une combinaison d’espèces peut dès lors provoquer des infections. Cependant, le rôle joué par la coespèce dans la progression de la maladie est mal compris et représente un défi de taille en termes de diagnostic. Le projet chelOMICS, financé par les Actions Marie Skłodowska-Curie (MSCA), propose une initiative multidisciplinaire ambitieuse afin de comprendre les interactions hôte-pathogène chez les poissons d’aquaculture en ce qui concerne la vibriose, la photobactériose et la furonculose, trois grandes maladies bactériennes. Le projet appliquera des outils multi-omiques modernes et aura recours à la métabolomique et à la métagénomique. chelOMICS s’intéressera tout particulièrement au métabolome des sidérophores, qui représentent des facteurs de virulence clés pendant l’infection, et à leur utilisation en tant que biomarqueurs pour le diagnostic précoce des maladies.

Objectif

Outbreaks of bacterial diseases pose a persistent challenge to fish farming around the world causing significant economic loss. To improve efficiency, safety, and sustainability of aquaculture new health monitoring and rapid disease diagnostics approaches are required. Here, we propose an ambitious multidisciplinary project that implements modern multi-omics tools, in particular metabolomics and metagenomics, to provide a holistic understanding of host-pathogen interactions in farmed fish in the context of three major bacterial diseases; vibriosis, photobacteriosis, and furunculosis. This project will focus specifically on the metabolome of siderophores, iron chelating microbial metabolites that are key virulence factors during infection, and their use as biomarkers for early disease diagnostics. In nature, microorganisms exist in diverse communities and therefore infections can be caused by a combination of species yet the involvement of co-species in disease progression is poorly understood and represents a great diagnostic challenge. I have gained extensive skills in metabolomics through my PhD in Australia and postdoctoral experience in Germany. This project will enable me to go one step further; I will use different bioinformatic tools as well as imaging analytical chemistry (MALDI-IMS) approaches to integrate metabolomics and microbiome data and answer important ecological questions in aquaculture. I am highly motivated to take on this new challenge and acquire new scientific and transferable skills, which will strengthen my profile as an independent researcher and increase my opportunities for a permanent position after the fellowship.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2021-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

UNIVERSIDADE DA CORUNA
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 181 152,96
Adresse
CALLE DE LA MAESTRANZA 9
15001 La Coruna
Espagne

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Région
Noroeste Galicia A Coruña
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Partenaires (2)

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