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chelOMICS: Application of multi-OMICS approaches to provide a holistic understanding of siderophore mediated host-pathogen interactions and new diagnostic options for aquaculture fish infections

Descrizione del progetto

Diagnostica rapida delle malattie batteriche per l’acquacoltura

I focolai di malattie batteriche rappresentano una problematica costante nell’itticoltura, con conseguenti perdite economiche significative. In natura, i microrganismi vivono in comunità diverse e una combinazione di specie può quindi causare infezioni. Tuttavia, il coinvolgimento della co-specie nella progressione della malattia è poco conosciuto e rappresenta una sfida diagnostica significativa. Il progetto chelOMICS, finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie (MSCA), propone un’ambiziosa iniziativa multidisciplinare per comprendere le interazioni ospite-patogeno nei pesci d’acquacoltura in relazione a vibriosi, fotobatteriosi e foruncolosi, tre importanti malattie batteriche. Il progetto chelOMICS applicherà moderni strumenti di multiomica, metabolomica e metagenomica, concentrandosi sul metaboloma dei siderofori, fattori di virulenza chiave durante l’infezione, e sul loro utilizzo come biomarcatori per la diagnosi precoce della malattia.

Obiettivo

Outbreaks of bacterial diseases pose a persistent challenge to fish farming around the world causing significant economic loss. To improve efficiency, safety, and sustainability of aquaculture new health monitoring and rapid disease diagnostics approaches are required. Here, we propose an ambitious multidisciplinary project that implements modern multi-omics tools, in particular metabolomics and metagenomics, to provide a holistic understanding of host-pathogen interactions in farmed fish in the context of three major bacterial diseases; vibriosis, photobacteriosis, and furunculosis. This project will focus specifically on the metabolome of siderophores, iron chelating microbial metabolites that are key virulence factors during infection, and their use as biomarkers for early disease diagnostics. In nature, microorganisms exist in diverse communities and therefore infections can be caused by a combination of species yet the involvement of co-species in disease progression is poorly understood and represents a great diagnostic challenge. I have gained extensive skills in metabolomics through my PhD in Australia and postdoctoral experience in Germany. This project will enable me to go one step further; I will use different bioinformatic tools as well as imaging analytical chemistry (MALDI-IMS) approaches to integrate metabolomics and microbiome data and answer important ecological questions in aquaculture. I am highly motivated to take on this new challenge and acquire new scientific and transferable skills, which will strengthen my profile as an independent researcher and increase my opportunities for a permanent position after the fellowship.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2021-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSIDADE DA CORUNA
Contributo netto dell'UE
€ 181 152,96
Indirizzo
CALLE DE LA MAESTRANZA 9
15001 La Coruna
Spagna
Regione
Noroeste Galicia A Coruña
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato

Partner (2)