Projektbeschreibung
Schnelldiagnostik für bakterielle Erkrankungen in Aquakulturen
In der Fischzucht stellen Ausbrüche bakterieller Krankheiten eine ständige Herausforderung dar, die erhebliche wirtschaftliche Verluste nach sich ziehen. In der Natur kommen Mikroorganismen in vielfältigen Gemeinschaften vor. Folglich kann eine Kombination von Arten Infektionen hervorrufen. Die Beteiligung mehrerer Spezies am Krankheitsgeschehen ist jedoch nur unzureichend erforscht und bereitet große diagnostische Probleme. Das im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen finanzierte Projekt chelOMICS schlägt eine ehrgeizige multidisziplinäre Initiative vor, um die Wechselwirkungen zwischen Wirt und Erreger bei Aquakulturfischen in Bezug auf Vibriose, Photobakteriose und Furunkulose, drei wichtige bakterielle Krankheiten, zu durchschauen. Das Projekt chelOMICS wird moderne Multi-Omik-Instrumente, Metabolomik und Metagenomik einsetzen. Dabei wird es sich auf das Metabolom von Siderophoren, die während der Infektion wichtige Virulenzfaktoren darstellen, und deren Verwendung als Biomarker zur Frühdiagnostik von Krankheiten konzentrieren.
Ziel
Outbreaks of bacterial diseases pose a persistent challenge to fish farming around the world causing significant economic loss. To improve efficiency, safety, and sustainability of aquaculture new health monitoring and rapid disease diagnostics approaches are required. Here, we propose an ambitious multidisciplinary project that implements modern multi-omics tools, in particular metabolomics and metagenomics, to provide a holistic understanding of host-pathogen interactions in farmed fish in the context of three major bacterial diseases; vibriosis, photobacteriosis, and furunculosis. This project will focus specifically on the metabolome of siderophores, iron chelating microbial metabolites that are key virulence factors during infection, and their use as biomarkers for early disease diagnostics. In nature, microorganisms exist in diverse communities and therefore infections can be caused by a combination of species yet the involvement of co-species in disease progression is poorly understood and represents a great diagnostic challenge. I have gained extensive skills in metabolomics through my PhD in Australia and postdoctoral experience in Germany. This project will enable me to go one step further; I will use different bioinformatic tools as well as imaging analytical chemistry (MALDI-IMS) approaches to integrate metabolomics and microbiome data and answer important ecological questions in aquaculture. I am highly motivated to take on this new challenge and acquire new scientific and transferable skills, which will strengthen my profile as an independent researcher and increase my opportunities for a permanent position after the fellowship.
Wissenschaftliches Gebiet
Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigenFinanzierungsplan
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordinator
15001 La Coruna
Spanien