Opis projektu
Szybka diagnostyka chorób bakteryjnych w akwakulturze
Ogniska chorób bakteryjnych stanowią stałe wyzwanie dla hodowli ryb, prowadząc do znacznych strat ekonomicznych. W przyrodzie mikroorganizmy występują w zróżnicowanych skupiskach. W konsekwencji, łączenie gatunków może być przyczyną infekcji. Jednakże udział współegzystujących gatunków w postępie choroby jest słabo poznany i stanowi istotne wyzwanie diagnostyczne. Zespół projektu chelOMICS finansowanego przez działania „Maria Skłodowska-Curie” proponuje ambitną multidyscyplinarną inicjatywę mającą na celu zrozumienie interakcji gospodarz-patogen u ryb hodowanych w ramach akwakultury w odniesieniu do wibrioz, fotobakteriozy i zakażenia bruzdogłowcem, trzech głównych chorób bakteryjnych. W projekcie zostaną zastosowane nowoczesne narzędzia multiomiczne, metabolomika i metagenomika. Naukowcy skupią się na metabolomie sideroforów, które są kluczowymi czynnikami wirulencji podczas infekcji, oraz na ich wykorzystaniu jako biomarkerów do wczesnej diagnostyki choroby.
Cel
Outbreaks of bacterial diseases pose a persistent challenge to fish farming around the world causing significant economic loss. To improve efficiency, safety, and sustainability of aquaculture new health monitoring and rapid disease diagnostics approaches are required. Here, we propose an ambitious multidisciplinary project that implements modern multi-omics tools, in particular metabolomics and metagenomics, to provide a holistic understanding of host-pathogen interactions in farmed fish in the context of three major bacterial diseases; vibriosis, photobacteriosis, and furunculosis. This project will focus specifically on the metabolome of siderophores, iron chelating microbial metabolites that are key virulence factors during infection, and their use as biomarkers for early disease diagnostics. In nature, microorganisms exist in diverse communities and therefore infections can be caused by a combination of species yet the involvement of co-species in disease progression is poorly understood and represents a great diagnostic challenge. I have gained extensive skills in metabolomics through my PhD in Australia and postdoctoral experience in Germany. This project will enable me to go one step further; I will use different bioinformatic tools as well as imaging analytical chemistry (MALDI-IMS) approaches to integrate metabolomics and microbiome data and answer important ecological questions in aquaculture. I am highly motivated to take on this new challenge and acquire new scientific and transferable skills, which will strengthen my profile as an independent researcher and increase my opportunities for a permanent position after the fellowship.
Dziedzina nauki
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
15001 La Coruna
Hiszpania