Projektbeschreibung
Modellierung der Artenvielfalt durch mitochondriale DNS
Biodiversitätsverlust bezeichnet den Rückgang der Artenvielfalt in einem bestimmten Lebensraum. Gewisse Arten sind sogar weltweit vom Aussterben bedroht. Dies ist von großer Bedeutung für das gesamte Ökosystem und erfordert Werkzeuge, die Bedrohungen für das Überleben von Arten, wie z. B. Krankheitserreger oder Veränderungen des Lebensraums, schnell erkennen können. Das Team des Projekts NIPMAP, das im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen finanziert wird, schlägt vor, einen auf mitochondrialer DNS basierenden Ansatz zur Einschätzung der Diversität von Amphibien und ihren Krankheitserregern zu entwickeln. Die Forschenden werden diese Informationen – zusammen mit Daten zur Übertragung von Krankheitserregern und Umweltvariablen – zu einem Modell kombinieren, das einen Beitrag zu Schutz und Erhaltung der Arten leisten wird.
Ziel
The current global biodiversity crisis requires rapid, inexpensive and reliable methods of detecting the main threats to species survival: pathogens, habitat change, and loss of genetic diversity1. Equally crucial are solutions for stemming biodiversity loss: we lack vital models that determine how these threats interact, which would help prioritise conservation efforts. Recently, CRI-CG has discovered for one species of frog over a relatively small geographic area that eDNA extracted from water samples captures more genetic diversity than analyses using tissue samples (UNESCO-funded project ACQUAVIVA). The same eDNA can be used to detect amphibian pathogens. NIPMAP will apply this knowledge in an innovative way by: i) optimizing this eDNA approach to estimate mtDNA diversity in four amphibian taxa (two caudates, two anurans) and pathogen diversity (principal pathogens: Bd, Bsal, Rv) across the eastern Italian Alps; ii) using these data to inform individual-based and spatially explicit simulations of host movements and pathogen transmission37; iii) integrating parameters from i-ii with skin microbiota and other health indices, as well as iv) environmental variables at each sample site, to generate correlative models (e.g. GLMMs and SDMs) and potential distribution maps to direct conservation management decisions. We will also pilot two innovative eDNA protocols: one to measure nuclear DNA diversity (to measure current gene flow and dispersal rates) and one to understand microbiota function using metatranscriptomics. These interdisciplinary tools will be integrated into a workflow that will be applicable to animal taxa anywhere on the planet.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2021-PF-01
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HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordinator
38098 San Michele All'Adige
Italien