Projektbeschreibung
DNS-Erkennungskartierung in Echtzeit
Die Überwachung verschiedener Krankheiten wie Krebs kann zeitaufwendig und teuer sein. Eine schnellere, weniger invasive Methode zu ihrer Überwachung wäre von Vorteil. Das EU-finanzierte Projekt BIoRead hat sich zum Ziel gesetzt, Nanogeräte zur Analyse einzelner DNS-Moleküle für die Flüssigbiopsie zu entwickeln. Im Ergebnis steht das „Laser-Assisted DNA Optical Mapping“ (LADOM) – eine Methode, mit der DNS-Moleküle aus einer Probe in Echtzeit nachgewiesen werden können. LADOM erbringt eine schnelle und einfache DNS-Analyse und weist winzige DNS-Fragmente mit weniger als einem Mikroliter Flüssigkeit nach. Durch die Nutzung dieser Hochdurchsatzmethode zur Analyse einzelner DNS-Moleküle für die Flüssigbiopsie und andere biomedizinische Anwendungen zielt das Projekt darauf ab, die Technologie zu standardisieren und sie auf den Markt zu bringen.
Ziel
The aim of this project is to use an ultra-fast, high throughput method for analysing DNA single molecules for liquid biopsy and other biomedical applications. The proposed methodology, “Laser-Assisted DNA Optical Mapping (LADOM)”, allows retrieving the barcode of single molecules of DNA in real time, as they flow through a nanochannel in a fluidic device. It combines a cheap device fabrication, flexible DNA labelling (customizable for different applications), microscope- and camera-free set up, a read-out sensitive to single molecules, very high throughput (tens of molecules per minute), ability to detect very small fragments, and no limitation for the maximum molecule’s length, what is especially interesting for applications dealing with ultra-long intact, genomic DNA.
In this project, we request funding to offer a service to analyze samples from possible stakeholders from the biomedical sector, and to standardize the technology and improve the troughput bThe aim of this project is to use an ultra-fast, high throughput method for analysing DNA single molecules for liquid biopsy and other biomedical applications. The proposed methodology, “Laser-Assisted DNA Optical Mapping (LADOM)”, allows retrieving the barcode of single molecules of DNA in real time, as they flow through a nanochannel in a fluidic device. It combines a cheap device fabrication, flexible DNA labelling (customizable for different applications), microscope- and camera-free set up, a read-out sensitive to single molecules, very high throughput (tens of molecules per minute), ability to detect very small fragments, and no limitation for the maximum molecule’s length, what is especially interesting for applications dealing with ultra-long intact, genomic DNA.
In this project, we request funding to offer a service to analyze samples from possible stakeholders from the biomedical sector, and to standardize the technology and improve the troughput by developing a software to automate the data analysis.
Wissenschaftliches Gebiet
Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Thema/Themen
Finanzierungsplan
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept GrantsGastgebende Einrichtung
20148 Hamburg
Deutschland