Projektbeschreibung
Mit alter DNS die Tuberkuloseausbreitung in Südamerika nachverfolgen
Tuberkulose ist eine hochansteckende Krankheit, die durch den Mycobacterium tuberculosis-Komplex verursacht wird. Die Forschung hat sich in erster Linie auf bestimmte Abstammungslinien konzentriert, insbesondere auf die vierte, die sich während der kolonialen Expansion von Europa nach Amerika ausbreitete. Jüngste Fortschritte in der Erforschung alter DNS bergen jedoch das Potenzial, zu einem umfassenderen Verständnis der Tuberkulose zu gelangen. Der Mycobacterium tuberculosis-Komplex ist wahrscheinlich vor 6 000 Jahren entstanden, also innerhalb eines späteren Zeitfensters als bisher angenommen. Das Ziel des EU-finanzierten Projekts PATHOGEN besteht im Einsatz von Verfahren mit alter DNS, um positive Tuberkuloseinfektionen bei Menschen aus Argentinien zu untersuchen. Ziel ist es, die Vielfalt und Verbreitung von Stämmen des Mycobacterium tuberculosis-Komplexes im südlichen Teil Amerikas zu beleuchten und eine neue Perspektive auf die evolutionäre und epidemiologische Geschichte der Tuberkulose zu eröffnen.
Ziel
Tuberculosis (TB), the infectious disease produced by the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC), remains one of the highest
global disease burdens. However, the current body of knowledge on the MTBC is biased towards certain lineages, particularly lineage 4 that spread from Europe to the Americas during colonial expansion. Recent advances in ancient DNA research have the potential to broaden this picture with the recovery and analysis of whole genomes from strains that infected human populations in the past. Indeed, these approaches have been recently used to identify ancient MTBC animal associated strains infecting humans in South American before the arrival of Europeans. Analysis of these strains estimated that the MTBC most likely emerged during the Neolithic approximately 6000 years ago (much later than previously thought). The PATHOGEN project, will seek to use these approaches to shed new light on the emergence, diversity and spread of MTBC strains in the Southern Cone of the Americas, a neglected region concerning the epidemiological history of TB. By employing ancient DNA methods to examine and screen putatively positive TB infections of humans from archaeological and historic contexts of the current territory of Argentina, I will potentially provide genomic representation of TB histories over a broad time transect from precolonial populations to post-colonial cemeteries. With these data, I will perform phylogenomic and molecular clock analyses to investigate i) changes in strain diversity over time in the region, ii) the historical and socio-economical contexts that favoured the emergence and spread of the detected strains, iii) the emergence of genetic changes with potential clinical relevance identified in MTBC strains over the past centuries. By offering a view of the past, the PATHOGEN project will increase our understanding of the diversity of MTBC across time and contribute a new perspective of the evolutionary and epidemiological histories of TB.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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75724 Paris
Frankreich