Projektbeschreibung
Innovative Ganzkörper-Stoffwechselmodelle für die personalisierte Medizin
Ganzgenomsequenzen sind zunehmend verfügbar, was den Übergang zur personalisierten Medizin erleichtert. Es ist jedoch wichtig zu verstehen, welche genetischen Varianten die Eigenschaften einer Person beeinflussen. Genomweite Assoziationsstudien haben genetische Varianten mit zahlreichen Merkmalen in Verbindung gebracht, bei diesen Methoden wird jedoch das biochemische Netzwerk nicht berücksichtigt, das diese Varianten mit dem metabolischen Phänotyp verbindet. Externe Faktoren wie die Ernährung und das Mikrobiom spielen ebenfalls eine Rolle bei der Modulation des metabolischen Phänotyps. Das ERC-finanzierte Projekt AVATAR zielt auf die Entwicklung eines neuen Computermodellierungsrahmens zur Verbesserung von Ganzkörper-Stoffwechselmodellen ab. Es sollen In-silico-Modelle erstellt werden, die genetische Varianten, Gene, Proteine, biochemische Reaktionen und zugrunde liegende physiologische Prozesse erklären, die den mikrobiellen Stoffwechsel und den Nährstoff-Stoffwechsel beeinflussen. AVATAR wird einen personalisierten Modellanalyserahmen für computergestützte Diagnostik- und Behandlungsstrategien bieten.
Ziel
The increasing availability of whole-genome sequences will ultimately transform medicine into personalised medicine. To realise this potential, we need to understand which of the millions of genetic variants in a person’s genome can alter a phenotype. Genome-wide association studies (GWAS) have associated many genetic variants with thousands of phenotypic traits. Metabolomics has further informed GWAS. However, these methods do generally not consider the biochemical network connecting genetic variants with the metabolic phenotype. Additionally, extrinsic factors, such as diet and the microbiome, also modulate the metabolic phenotype. A computational systems approach is required to untangle this complex interplay. In AVATAR, I shall develop and apply a novel mechanistic computational modelling framework that will significantly expand cutting-edge computational models of whole-body metabolism. The novel in silico models will mechanistically describe the network of genetic variants, genes, proteins, and biochemical reactions, as well as underlying physiological processes that are influenced by microbial and nutrient metabolism. I shall devise a novel algorithm to predict phenotypically relevant genetic variants based on a person’s genome and metabolome. The validated algorithm and the modelling framework shall then be used for two distinct biomedical proof-of-concept studies: the diagnosis and diet-based treatment of inherited metabolic diseases and the metabolic pathway-based stratification of individuals with cognitive impairment. AVATAR will enable novel insights into the genotype-phenotype-environment relationship by enabling systematic mechanism-based analyses of genetic variants, diet, and the microbiome. This ground-breaking, innovative, multidisciplinary project will influence precision medicine by providing a personalisable modelling analysis framework that may ultimately provide a foundation for computer-guided diagnosis and treatment strategies.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Metabolome
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Gesundheitswissenschaften Ernährung
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-COG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
H91 Galway
Irland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.