Opis projektu
Innowacyjne modele metabolizmu całego organizmu na potrzeby medycyny spersonalizowanej
Sekwencje całych genomów są coraz powszechnie dostępne, co ułatwia wdrażanie medycyny spersonalizowanej. Trzeba jednak ustalić, które warianty genetyczne wpływają na cechy danej osoby. Badania asocjacyjne całego genomu pozwalają powiązać warianty genetyczne z wieloma cechami, ale metody te nie uwzględniają sieci biochemicznej łączącej te warianty z fenotypem metabolicznym. Wynika to z faktu, że czynniki zewnętrzne, takie jak dieta i mikrobiom, również odgrywają rolę w modulowaniu fenotypu metabolicznego. Finansowany przez ERBN projekt AVATAR zakłada opracowanie nowych ram modelowania obliczeniowego w celu ulepszenia modeli metabolizmu całego organizmu. Zespół stworzy modele in silico, które będą wyjaśniać warianty genetyczne, geny, białka, reakcje biochemiczne i podstawowe procesy fizjologiczne wpływające na metabolizm drobnoustrojów i składników odżywczych. W projekcie AVATAR powstaną spersonalizowane ramy do analizy modelowania na potrzeby wspomaganej komputerowo diagnostyki i strategii leczenia.
Cel
The increasing availability of whole-genome sequences will ultimately transform medicine into personalised medicine. To realise this potential, we need to understand which of the millions of genetic variants in a person’s genome can alter a phenotype. Genome-wide association studies (GWAS) have associated many genetic variants with thousands of phenotypic traits. Metabolomics has further informed GWAS. However, these methods do generally not consider the biochemical network connecting genetic variants with the metabolic phenotype. Additionally, extrinsic factors, such as diet and the microbiome, also modulate the metabolic phenotype. A computational systems approach is required to untangle this complex interplay. In AVATAR, I shall develop and apply a novel mechanistic computational modelling framework that will significantly expand cutting-edge computational models of whole-body metabolism. The novel in silico models will mechanistically describe the network of genetic variants, genes, proteins, and biochemical reactions, as well as underlying physiological processes that are influenced by microbial and nutrient metabolism. I shall devise a novel algorithm to predict phenotypically relevant genetic variants based on a person’s genome and metabolome. The validated algorithm and the modelling framework shall then be used for two distinct biomedical proof-of-concept studies: the diagnosis and diet-based treatment of inherited metabolic diseases and the metabolic pathway-based stratification of individuals with cognitive impairment. AVATAR will enable novel insights into the genotype-phenotype-environment relationship by enabling systematic mechanism-based analyses of genetic variants, diet, and the microbiome. This ground-breaking, innovative, multidisciplinary project will influence precision medicine by providing a personalisable modelling analysis framework that may ultimately provide a foundation for computer-guided diagnosis and treatment strategies.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia metabolomy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- medycyna i nauki o zdrowiu nauki o zdrowiu odżywianie
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2023-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
H91 Galway
Irlandia
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.