Projektbeschreibung
Die Mechanismen der Kern- und Genommechanik erforschen
Die Kerne in lebenden Zellen sind ständig inneren und äußeren Kräften ausgesetzt, die die Kernmembran verformen. Chromosomen sind mechanische Strukturen, die mechanische Kräfte wahrnehmen, weiterleiten und absorbieren. Interchromosomale Kontakte und mit der Kernmembran verbundene Domänen beeinflussen die Übertragung von mechanischem Stress, wenn Zellen komprimiert, gedehnt oder interstitiell migriert werden. Ziel des ERC-finanzierten Projekts TOPOMECH ist es, die mechanischen Eigenschaften von Chromosomen zu erforschen und zu untersuchen, wie sich Verformungen des Kerns auf die Integrität des Genoms und die topologische Landschaft des Chromatins auswirken. Dazu werden mechanistische, genetische und genomische Studien in Hefe durchgeführt, gefolgt von genomischen, bildgebenden und mikrofluidischen Ansätzen in Säugetierzellen. Insgesamt wird diese Studie zu einem tieferen Verständnis der Mechanismen hinter den pathologischen Prozessen führen, die bestimmte Mechanokrankheiten auslösen können.
Ziel
The nucleus is the stiffest organelle in the cell and is constantly challenged by intrinsic and extrinsic forces that deform the nuclear envelope. Chromosomes are mechanical objects that can sense, transduce and adsorb mechanical forces. Inter-chromosomal contacts and nuclear envelope-associated domains contribute to transduce mechanical stress when cells experience compression, stretching or interstitial migration.
We aim to study the mechanical properties of the chromosomes and how genome integrity and the chromatin topological landscape are affected by nuclear deformations. We will combine mechanistic, genetic and genomic studies in yeast (WP1) with genomic, imaging and microfluidic approaches in mammalian cells (WP2). In WP1 we will investigate i) how the topological context influences nucleosome chirality and the epigenetic landscape; ii) how the inter-chromosomal connections mediated by topoisomerase activities influence genome mechanics; iii) how chromosome topology contributes to generate aberrant DNA structures and how DNA damage induces topological changes; iv) how the nuclear envelope and the nucleolus influence chromatin topology and histone modifications; v) how nuclear deformation affects genome integrity and the topological landscape. In WP2 we will study: i) the ATR and ATM-mediated mechanisms controlling nuclear and genome integrity and mechanics, under unperturbed conditions or in response to mechanical stress; ii) how the topological context of the genome responds to mechanical forces generated by cell compression or stretching and the implications for fragile site expression; iii) how mechanical stress generated by interstitial migration influences genome topology, chromosome instability, and those mechanisms causing amplification of specific chromosomal loci.
The expected results may contribute to elucidate the mechanisms controlling nuclear and genome mechanics and those pathological processes promoting certain mechano-diseases.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Mathematik reine Mathematik Topologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-ADG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
00185 Roma
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.