Descrizione del progetto
Chiarire i meccanismi alla base della meccanica nucleare e del genoma
I nuclei delle cellule viventi sono continuamente esposti a forze interne ed esterne che distorcono l’involucro nucleare e i cromosomi sono strutture meccaniche in grado di percepire, trasdurre e assorbire forze meccaniche; i contatti intercromosomici e i domini legati all’involucro nucleare influenzano la trasduzione dello stress meccanico quando le cellule sono sottoposte a compressione, stiramento o migrazione interstiziale. Il progetto TOPOMECH, finanziato dal CER, si prefigge di esplorare le proprietà meccaniche dei cromosomi e il modo in cui le deformazioni nucleari influiscono sull’integrità del genoma e sull’ambiente topologico della cromatina. Il gruppo condurrà studi meccanicistici, genetici e genomici nel lievito che saranno seguiti da approcci genomici, immaginografici e microfluidici in cellule di mammifero. Nel complesso, lo studio consentirà di sviluppare una comprensione più approfondita dei meccanismi alla base dei processi patologici che possono innescare alcune meccano-malattie.
Obiettivo
The nucleus is the stiffest organelle in the cell and is constantly challenged by intrinsic and extrinsic forces that deform the nuclear envelope. Chromosomes are mechanical objects that can sense, transduce and adsorb mechanical forces. Inter-chromosomal contacts and nuclear envelope-associated domains contribute to transduce mechanical stress when cells experience compression, stretching or interstitial migration.
We aim to study the mechanical properties of the chromosomes and how genome integrity and the chromatin topological landscape are affected by nuclear deformations. We will combine mechanistic, genetic and genomic studies in yeast (WP1) with genomic, imaging and microfluidic approaches in mammalian cells (WP2). In WP1 we will investigate i) how the topological context influences nucleosome chirality and the epigenetic landscape; ii) how the inter-chromosomal connections mediated by topoisomerase activities influence genome mechanics; iii) how chromosome topology contributes to generate aberrant DNA structures and how DNA damage induces topological changes; iv) how the nuclear envelope and the nucleolus influence chromatin topology and histone modifications; v) how nuclear deformation affects genome integrity and the topological landscape. In WP2 we will study: i) the ATR and ATM-mediated mechanisms controlling nuclear and genome integrity and mechanics, under unperturbed conditions or in response to mechanical stress; ii) how the topological context of the genome responds to mechanical forces generated by cell compression or stretching and the implications for fragile site expression; iii) how mechanical stress generated by interstitial migration influences genome topology, chromosome instability, and those mechanisms causing amplification of specific chromosomal loci.
The expected results may contribute to elucidate the mechanisms controlling nuclear and genome mechanics and those pathological processes promoting certain mechano-diseases.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali matematica matematica pura topologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica cromosomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
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Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2023-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
00185 Roma
Italia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.