Projektbeschreibung
Modellierung und Simulationen der Kondensatbildung bei neurodegenerativen Erkrankungen
Unlösliche biomolekulare Kondensate aus Nukleinsäuren und Proteinen mit mehreren Domänen, die sowohl gefaltete als auch ungeordnete Domänen aufweisen, sind ein Kennzeichen vieler fortschreitender neurodegenerativer Störungen und Krankheiten. Ihre Bildung hängt in hohem Maße von lokalen Bedingungen wie pH-Wert und Temperatur sowie von lokalen Umweltbestandteilen wie anderen Biopolymeren ab. Das über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützte Projekt MMultiDP zielt auf die Entwicklung des ersten quantitativen Berechnungsmodells ab, das das Scannen eines großen chemischen Raums und Temperaturraums ermöglicht. Es soll verwendet werden, um die Bildung von Kondensaten bei amyotropher Lateralsklerose, frontotemporaler Demenz und Autismus-Spektrum-Störungen mittels groß angelegter Molekulardynamiksimulationen zu untersuchen.
Ziel
Neurodegenerative disorders are one of the leading causes of disabilities and death in elderly populations worldwide. To this date, no established treatment can either prevent or slow down the progression of these diseases. Their occurrences and progression are strongly correlated with insoluble biological condensates composed of nucleic acids and proteins, where the latter are multi-domain proteins with both folded and disordered domains. The formation and the existence of biological condensates can be described through a combination of density (e.g. liquid-liquid phase separation) and network (percolation) transitions. These phase transitions are highly context-dependent (pH, temperature, etc.) and composition-dependent, i.e. the presence of other biopolymers, where these system variations can either enhance or suppress transitions or have a profound effect on the material properties of condensates formed. Currently, we lack computational approaches that can account for such system variations and predict the phase behavior of biological condensates. In this project, I will develop for the first time a quantitative computational model that will enable scanning a large chemical space, as well as, be temperature-sensitive. Next, I will use this model to identify the role of folded and disordered domains in the formation of condensates for two protein families related to amyotrophic lateral sclerosis, frontotemporal dementia, and autism spectrum disorder through large-scale molecular dynamics simulations. Lastly, I will deliver a microscopic understanding of how certain system variations are linked to neurodegenerative diseases, e.g. pH, the presence of other biopolymers, and changes in protein sequence affect the properties of biological condensates. I will carry out this project in the research group of Prof. Kresten Lindorff-Larsen at the University of Copenhagen (UCPH).
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Neurologie Demenz
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1165 KOBENHAVN
Dänemark
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.