Opis projektu
Modelowanie i symulacje tworzenia kondensatów w chorobach neurodegeneracyjnych
Nierozpuszczalne kondensaty biomolekularne złożone z kwasów nukleinowych i białek wielodomenowych z domenami zarówno sfałdowanymi, jak i nieuporządkowanymi są cechą charakterystyczną wielu postępujących schorzeń i chorób neurodegeneracyjnych. Ich powstawanie jest w dużym stopniu uzależnione od lokalnych warunków, takich jak pH i temperatura, oraz od lokalnych składników środowiskowych, takich jak obecność innych biopolimerów. Realizowany przy wsparciu programu działań „Maria Skłodowska-Curie” projekt MMultiDP ma na celu opracowanie pierwszego ilościowego modelu obliczeniowego, który umożliwi skanowanie dużej przestrzeni chemicznej i przestrzeni temperatur. Posłuży on do badania tworzenia się kondensatów w stwardnieniu zanikowym bocznym, demencji czołowo-skroniowej i zaburzeniach ze spektrum autyzmu za pomocą symulacji dynamiki molekularnej na dużą skalę.
Cel
Neurodegenerative disorders are one of the leading causes of disabilities and death in elderly populations worldwide. To this date, no established treatment can either prevent or slow down the progression of these diseases. Their occurrences and progression are strongly correlated with insoluble biological condensates composed of nucleic acids and proteins, where the latter are multi-domain proteins with both folded and disordered domains. The formation and the existence of biological condensates can be described through a combination of density (e.g. liquid-liquid phase separation) and network (percolation) transitions. These phase transitions are highly context-dependent (pH, temperature, etc.) and composition-dependent, i.e. the presence of other biopolymers, where these system variations can either enhance or suppress transitions or have a profound effect on the material properties of condensates formed. Currently, we lack computational approaches that can account for such system variations and predict the phase behavior of biological condensates. In this project, I will develop for the first time a quantitative computational model that will enable scanning a large chemical space, as well as, be temperature-sensitive. Next, I will use this model to identify the role of folded and disordered domains in the formation of condensates for two protein families related to amyotrophic lateral sclerosis, frontotemporal dementia, and autism spectrum disorder through large-scale molecular dynamics simulations. Lastly, I will deliver a microscopic understanding of how certain system variations are linked to neurodegenerative diseases, e.g. pH, the presence of other biopolymers, and changes in protein sequence affect the properties of biological condensates. I will carry out this project in the research group of Prof. Kresten Lindorff-Larsen at the University of Copenhagen (UCPH).
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Projekt nie został jeszcze sklasyfikowany według klasyfikacji EuroSciVoc.
Wskaż dziedziny nauki, które twoim zdaniem są najbardziej istotne z punktu widzenia tego projektu i pomóż nam usprawnić naszą usługę klasyfikacji.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
1165 KOBENHAVN
Dania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.