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Mapping path and fate diversity of molecular mechanisms of infection with smart microscopy

Projektbeschreibung

Visualisierung von bakteriellen Infektionswegen in Echtzeit

Bakterielle Krankheitserreger wie Yersinia pseudotuberculosis müssen die Bedingungen ihres Wirtsorganismus erkennen und sich schnell daran anpassen, um Immunreaktionen zu umgehen, sich zu vermehren und eine Infektion auszulösen. Das Verständnis dieser dynamischen Wechselwirkungen zwischen Wirt und Erreger ist von zentraler Bedeutung für die Entwicklung präziser Therapien und die Bekämpfung von Antibiotikaresistenzen. Das im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen geförderte Projekt InfPathMapper entwickelt eine Plattform für die Superauflösungsmikroskopie (Super-Resolution Microscopy, SRM), mit der einzelne Infektionsereignisse in Echtzeit sichtbar gemacht werden können. SRM geht über die Auflösungsgrenzen der standardmäßigen Lichtmikroskopie hinaus und ermöglicht die Abbildung molekularer Vorgänge in lebenden Zellen auf der Nanoskala. Die Forschenden werden SRM mit maschinellem Lernen kombinieren, um Infektionswege und Wirtsreaktionen zu untersuchen und so zu versuchen, wertvolle Erkenntnisse über die Infektion in einem frühen Stadium zu gewinnen.

Ziel

Pathogens like Yersinia pseudotuberculosis must rapidly adapt to environmental cues to progress through infection, manipulating host responses to survive and replicate. Understanding these adaptive host-pathogen interactions is key to developing targeted therapies, combating antibiotic resistance, and preventing chronic infections. However, current methods miss rare, transient infection stages, limiting our understanding of infection pathways. My project aims to address this by developing InfPathMapper, a data-driven super-resolution microscopy (SRM) platform to map infection pathways in living cells at molecular resolution.
While advances in fluorescence microscopy provide detailed molecular insights, they often struggle with phototoxicity, limited spatiotemporal resolution, and reliance on fixed samples, missing dynamic information of infection processes. My approach will extend a data-driven microscopy platform by integrating adaptive SRM modalities for live-cell imaging of Y. pseudotuberculosis infection, a pathogen with virulence mechanisms conserved across many bacteria. This system will be able to map pathways of individual infection events at super-resolution level in a live-cell fluorescence-based infection assay supported by machine learning to classify pathogen invasion stages and host cell response patterns. Live-to-fix super-resolution mapping of the molecular architecture of critical infection stages will provide new insights into how Yersinia adapts to niche-specific environments and host-induced stress. By combining cutting-edge microscopy with infection biology, the project will not only set me on an excellent pathway toward achieving research independence, it is also expected to contribute valuable knowledge and tools for the broader research community, fostering innovation in the study of other pathogens and dynamic intracellular processes and the fight against infectious diseases.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

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Koordinator

LUNDS UNIVERSITET
Netto-EU-Beitrag
€ 236 340,00
Adresse
Paradisgatan 5c
22100 Lund
Schweden
Region
Södra Sverige Sydsverige Skåne län
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
Keine Daten